为什么现在放线菌测序确定分类地位用16S rDNA,麻烦从专业的角度陈述!

来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/12/24 07:56:22
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最佳答案16SrDAN是编码原核生物核糖体小亚基rRNA(16SrRNA)的基因. 长度约为1500pb,是细菌分类学研究中最常用、最有用的“分子钟”,其序列包含10个可变区(variable region)和与之相同的11个恒定区(constant region),可变区因细菌而异,且变异程度与细菌的系统发育密切相关[1-3],Trand等通过对27株原核生物16SrDNA的比对发现其中至少在9个高度保守的寡聚体(oligomers);较之23SrDNA等看家基因而异,它具有分子大小适中,突变率小等优点,素有“细菌化石”之称[2,4].Woese等[3]与Olsen等[4]基于对16SrDNA的分析构建了现已被分认的全生命系统进化树,越来越多的细菌依据16SrDNA被正确分类或重分类,尤其是许多环境中的细菌[5.6],如Funke等将棒杆菌依赖细胞毒性1组及类似棒杆菌重新确定为放线菌的一个新种,即钮氏放线菌中,Bennasar等通过比较14株施氏假单胞菌的7基因型(DNA-DNA杂交同源组),发现SP1402T(T为模式株)和SL401与施氏假单胞菌模式株明显不同,从而命名为一个新种称巴利阿里假单胞菌(Pseudomonas balearica)[2];有的研究者还根据种内菌株间的RFLP而将各菌分为不同的核酸型(ribotype,RT)[7].
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