怎么样确定DNA上那些位点是蛋白质结合位点

来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/11/25 16:43:16
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怎么样确定DNA上那些位点是蛋白质结合位点
怎么样确定DNA上那些位点是蛋白质结合位点

怎么样确定DNA上那些位点是蛋白质结合位点
一般要通过实验验证.
常用的方法有:凝胶阻滞实验,DNaseI足迹实验,甲基化干扰试验.

知道了序列,首先可以通过软件来预测。这样的软件有很多,比如
http://alggen.lsi.upc.es/cgi-bin/promo_v3/promo/promoinit.cgi?dirDB=TF_8.3
得到大致的位置后,可以在通过各种实验手段来证实。比如ChIP, gel shift 等

一般需要做序列分析先,如果你的DNA是已知的,可以直接上公共数据库,比如NCBI, Ensembl, uniprot等数据库看看是不是已经有已知信息可以用了:比如 'DNA binding site: 123, 456....'
如果没有,就需要自己做序列分析了,可以用一些通用软件,也可以自己做些特定的分析。...

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一般需要做序列分析先,如果你的DNA是已知的,可以直接上公共数据库,比如NCBI, Ensembl, uniprot等数据库看看是不是已经有已知信息可以用了:比如 'DNA binding site: 123, 456....'
如果没有,就需要自己做序列分析了,可以用一些通用软件,也可以自己做些特定的分析。

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