如何从众多染色体中提取其中一个并PCR扩增其中一个基因?如题,比如人体支气管上皮细胞(HBE cell),一般好像是提取总DNA,然后好像就是PCR了吧?但如果是这样的话,那引物设计时不是要比对所
来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/12/18 20:35:49
如何从众多染色体中提取其中一个并PCR扩增其中一个基因?如题,比如人体支气管上皮细胞(HBE cell),一般好像是提取总DNA,然后好像就是PCR了吧?但如果是这样的话,那引物设计时不是要比对所
如何从众多染色体中提取其中一个并PCR扩增其中一个基因?
如题,
比如人体支气管上皮细胞(HBE cell),一般好像是提取总DNA,然后好像就是PCR了吧?但如果是这样的话,那引物设计时不是要比对所有染色体上的所有碱基以确定特异性,确定我的引物可以把,比如20号染色体上的某个基因给扩增出来?是不是这样呢?如果不是,应该如何做?
如何从众多染色体中提取其中一个并PCR扩增其中一个基因?如题,比如人体支气管上皮细胞(HBE cell),一般好像是提取总DNA,然后好像就是PCR了吧?但如果是这样的话,那引物设计时不是要比对所
你肯定不能比对所有序列,不可能的事吧.你想扩增基因,起码先知道了部分或者全部的序列,一般是知道了全部序列,按照原则设计好引物,提取总DNA然后pcr就行了.由于没有对比全部基因组序列,引物可能会扩增出其他基因或者基因片段.电泳一下,因为你知道你要的这个基因有多长,所以看下相应的bp位置,然后用试剂盒凝胶回收这个长度的DNA片段就行了.
另外没有从染色体中提取一个基因的说法,你都能提取出来,要PCR干啥呢.从染色体基因组中扩增基因.
就算基因组很庞大,但是你的引物长度到20个碱基左右就足够保证特异性了。
你想再找一段20个碱基的DNA序列一样概率多大?4的二十次方之一!基因组能有几个4的二十次方20bp长的片段?
假如,这是一道题,我的思路是:
首先,这个基因的序列是已知的还是未知的呢?
假如已知的话,就很容易,提取总DNA,然后利用primer3的软件,找到这段序列上下游的特异性位点,设计引物,然后扩增出来就行了,想要提高实验的可信度,可以电泳,切胶,送测序。
假如未知,就复杂一些了。就你提供的情况,好像是知道大概的位置,那么,你需要得到一张该生物的genetic map,确定该位...
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假如,这是一道题,我的思路是:
首先,这个基因的序列是已知的还是未知的呢?
假如已知的话,就很容易,提取总DNA,然后利用primer3的软件,找到这段序列上下游的特异性位点,设计引物,然后扩增出来就行了,想要提高实验的可信度,可以电泳,切胶,送测序。
假如未知,就复杂一些了。就你提供的情况,好像是知道大概的位置,那么,你需要得到一张该生物的genetic map,确定该位点附近的marker,找到离该位点最靠近的一对(或几对)特异性marker,扩增,电泳,切胶,得到单一片段,送测序,对比测序结果,得到可行的开放阅读框。
我是入门者,拙见,望高手指点。
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1,首先,没人去冲总DNA中分离1个染色体来扩增
2,20个bp的引物,扩增目标基因已经足够了,不用担心会有非常多的产物
3,上边说的第2条,是在你PCR条件非常合理的情况下,如果你扩出很多非特异性条带或者拖尾,建议改良PCR条件,使用热启动,降低退火温度等手段加强特异性条带。
4,当然,你要保证自己的引物设计的合理,尽量不要形成发夹结构,GC含量合适。。等等...
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1,首先,没人去冲总DNA中分离1个染色体来扩增
2,20个bp的引物,扩增目标基因已经足够了,不用担心会有非常多的产物
3,上边说的第2条,是在你PCR条件非常合理的情况下,如果你扩出很多非特异性条带或者拖尾,建议改良PCR条件,使用热启动,降低退火温度等手段加强特异性条带。
4,当然,你要保证自己的引物设计的合理,尽量不要形成发夹结构,GC含量合适。。等等
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