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RNA聚合酶四指示
沉默的内源性的DNA
我们先前发现的一种拟南芥sde4
突变说,展出的部分失去一个transgenesilencing
通路是否则依赖
对RNA依赖的RNA聚合酶六日
（ rdr6 ） （ 1 ） .该sde4突变体植株还
有缺陷的小分子干扰RNA （小分子干扰核糖核酸）
生产和甲基正弦retroelement
atsn1 （ 2 ）在通路其后
相关rdr2 , Dicer的样三日
（ dcl3 ） ,以及其他内源性的siRNA （ 3 ） .它
很可能,这沉默通路相关
以RNA干涉（ RNAi技术）介导heterochromatinization
在schizosaccharomyces
pombe这也是依赖于小分子干扰核糖核酸, Dicer的,
andanrdr （ 4 ） .所以,要调查
机制的两个转基因与retroelement
沉默,我们查处的分子
身份的sde4轨迹.我们这里所叙述
如何sde4编码最大亚基一
编码RNA聚合酶是有别于
真核细胞的RNA聚合酶的一,二和三
（其亚基在拟南芥中被指定
由前缀nrpa , nrpb ,或nrpc ,分别） .
在符合公约
命名的RNA聚合酶的,我们从今以后参考
这种酶作为RNA聚合酶四（油料
四）和世界上最大的亚基编码sde4
作为nrpd1a .先前所描述的sde4
突变是现在指定nrpd1a - 1 .
1sainsbury实验室,约翰建设起中心,诺里奇
nr4 7uh ,英国. 2university东英格兰,诺里奇
nr4 7tj ,英国.
*向谁函授应予以处理.
电子邮箱： david.baulcombe @是Sainsbury - laboratory.ac.uk
屏幕上有缺陷的突变体,在跨
基因沉默用一种拟南芥线
（ gxa ） ,其中绿色荧光蛋白
（ GFP ）的转基因（图s1a ,指定G ）的
鸦雀无声,由马铃薯X病毒（ pvx ） -绿色荧光蛋白
转基因（图s1a ,指定一） （ 1 ） .不像
rdr6突变体,其中完全失去绿色荧光蛋白
沉默在gxa背景下, nrpd1a - 1
展示了一幅延迟性发作的沉默中
生长点的植物（图1A和图.
s1f ） （ 1 ） .在年轻的植物,叶片初期
涌现出绿色荧光蛋白的荧光,而且,在一个星期内,
沉默出现在局部地区,然后
散布在整个叶片.这种迟发性
表型的坚持,直到开花的时候
年轻的花序均GFP的荧光.
该模式的转基因mRNA和
小分子干扰核糖核酸积累相应的
数额GFP的荧光.因此,北
分析野生型和nrpd1a - 1鲜花
表明,增加积累的GFP
mRNA的表达（ 4.5倍）和pvx -绿色荧光蛋白基因的RNA
nrpd1a - 1对应到六倍减少
21日至24日-核苷酸（ NT ）的绿色荧光蛋白的siRNA （图
1B ）条相对野生型.在完全沉默
玫瑰花叶,那里nrpd1a介导的损失
沉默是不太明显高于
花卉,绿色荧光蛋白基因和siRNA金额
媲美.
RNA介导的DNA甲基化（ rddm ）
是与沉默的植物,并
可能导的一个小分子干扰核糖核酸引导效应
复杂的.一致rddm在绿色荧光蛋白
轨迹gxa植物,绿色荧光蛋白基因的DNA甲基化是
迷失在鲜花的rdr6和sgs3突变体沿
23 .长pfeifhofer等人,威廉斯年限.地中海. 197 , 1525 （ 2003 ） .
24 .汤匙egawa等人,电流.生物学. 13 , 1252 （ 2003 ） .
25 .支持由美国国家卫生署（ r37 - ai33443 ） .我们想
谢谢j. pober ,每小时十孙,和D罗斯坦为
认真研读了这份手稿和第十林（大学
水牛） ,为分享card11缺陷
Jurkat细胞.分子相互作用数据已
存放在生物分子相互作用网络
数据库与加入代码209039到209044 .
支持在线材料
www.sciencemag.org/cgi/content/full/308/5718/114/
无线TTL闪光灯
材料与方法
无花果.中一至中三
2004年11月4日;接受, 2005年1月14日
10.1126/science.1107107
与绿色荧光蛋白的siRNA （ 1 ） （图1 C ） .在nrpd1a - 1
花卉,如绿色荧光蛋白的siRNA都减少,但
不缺席,我们只发现有轻微变化
该模式GFP的DNA甲基化（图1 C ）
这反差更明显的损失
atsn1 DNA甲基化nrpd1a - 1植物
（ 2 , 5 ） .因此, nrpd1a通路,是不是
唯一来源合适的siRNA为rddm .
当初nrpd1a - 1 ,在相当大的重排
1号染色体扰乱
at1g63020 （图中一,二至七） ,然后用
其他nrpd1a等位基因与互补
同一个nrpd1a转,以确认
这种基因编码的nrpd1a .序列
nrpd1a不结盟与拟南芥nrpd1a
同源（编码at2g40030 ）和两个
编码蛋白质的水稻植物特有
分支为最大亚基的RNA
聚合酶（图2A及fig.s2 , A至C ） .
一致nrpd1a作为世界上最大的
亚基一multisubunit油料四,食米
和拟南芥基因组编码两个
蛋白质可以成为第二大
亚基（ at3g18090和at3g23780 ） （ 6 ）
（图2B和图s2d ） .测试沉默
的作用,这些基因拟南芥nrpd2
亚基,我们转化野生型gxa
植物倒置重复序列（ IR ）的构造说
将目标对准了RNAi以nrpd1a ,疑似
nrpd2基因,或阿丹（作为对照组） （图三,
A和B ） .转化与红外
针对nrpd1a与疑似
nrpd2基因,但并不反对阿丹（图三, c
及d ） ,呈现延迟性发作的沉默
这样的nrpd1a - 1 .虽然两者nrpd2
基因将被灭活,由红外兴建
（图s3b ） ,两条路线的证据表明,
积极nrpd2轨迹,而不是at3g23780
比at3g18090 .第一,基因特异性扭转
转录聚合酶链反应（ RT - PCR ）
分析结果表明,大部分的nrpd2
誊来自at3g23780 （图s3e ）
及第二,在一个插入突变体at3g23780
（ nrpd2a - 1 ,图s3f ） ,但不at3g18090
（ nrpd2b - 1 ,图s3f ）消除了内源
小分子干扰核糖核酸（图3A ）在.
nrpd1a和nrpd2有顺序的异同
他们nrpa , nrpb , nrpc
同系物,在地区相应的功能
重要的特点,酵母RNA聚合酶
2005年4月1日第一卷308科学www.sciencemag.org
报告
图. 1 . GFP的沉默nrpd1a - （一） 1 .紫外线照片gxa野生
型（ WT ）的,并nrpd1a - 1开花植物. （二）北方分析绿色荧光蛋白
mRNA的表达和siRNA在花卉（六） ,茎（ s ）和叶（ 1 ）由WT和
nrpd1a - 1 gxa植物. （三） Southern blot分析基因组DNA纯化
二（ 7 ） .为nrpd1a ,地区与认同
nrpb1包括N端钳核心
（ 20 ％ ） ,锌金属结合位点,活跃
网站（ 41 ％ ） ,漏斗和部分裂隙
域（初, 42 ％ ,末位淘汰,有24 ％ ） .该
中的裂隙域nrpa1 ,
nrpb1 , nrpc1缺席nrpd1a
（保守区七） （图s2b ） .然而,
C端钳核心（图s2b ） ,它定义了
年底球形域之前
C端域（ CTD是） nrpb1 （ 7 ） ,是
目前（ 23 ％相同） . nrpd2是34 ％相同
以nrpb2并保守区
相对应的结合位点小
核心亚基（ nrpb3/ac40 , nrpb10 ,
nrpb12 ） （图s2d ） ,这是思想的发挥
作用于酶大会（ 7 ） .有多重
基因nrpb3/ac40 ,有些企业
他们可以油料四的具体情况.然而,对于
nrpb10和nrpb12现在只有两个基因
每一个在拟南芥中,他们可以分享
油料之间的第四和其他的RNA聚合酶
因为他们是在其他真核生物（ 8 ） .
最引人注目的区别
nrpb1和nrpd1a是在C端的
nrpd1 ,如水稻和拟南芥
蛋白质分享相似的C端
半数一个无编码的蛋白（有缺陷
叶绿体和叶片）规范S rRNA基因
加工叶绿体（ 9 ） （图s2a ） .这
C端延伸,可协调的RNA
聚合酶活性与下游加工
步骤,在方式上类似于向
CTD是ofpolii （ 8 ） .结合本
不寻常的C端与保守的特点
义RNA聚合酶表明,波兰四是
积极RNA聚合酶与重要分歧
从义RNA聚合酶的一,二和三.
来自同一组织中,作为第（二）项,消化与甲基化敏感性
酶sau96i ,摸索出为GFP的. unmethylated G和gxa sgs3线
作为对照. DNA片段大于554新台币,是由于DNA的
甲基化.
图. 2 .进化树
最大型的（ a ）和
第二大（二）的RNA
聚合酶亚基家庭
从植物中,蠕虫和
酵母. itoivonthe权
对每棵树显示核糖核酸
聚合酶亚科.灰色
和黑盒子显示
拟南芥油料四亚基.
为了进一步探讨机制的油料
四介导的沉默,我们的另一个特点是
突变与迟发性GFP的沉默
（图s4a ） .它有一个倒置4号染色体
这会破坏rdr2 （图s4b , rdr2 - 3 ） ,以及
绿色荧光蛋白基因沉默的表型能够加以补充
通过改造与野生型rdr2
基因组DNA （图s4a ） .在这突变,因为在
nrpd2a - 1和的每一项nrpd1a突变,有
获得较低的数额内源性24 -新台币
siRNA （即atsn1 , 1003 , 02 ,与第2组） ,比
在野生型,而mir167数额
未受影响（图3A ）在（ 3 ） .这些的siRNAs都
在24新台币大小级,并dcl3 Dicer的是
参与它们的生源（ 3 ） .这是有可能
因此,油料四, rdr2 , dcl3法
团结起来,为一个沉默的门路.油料四将
产生的RNA的物种被复制到
双链RNA （双链RNA ） rdr2 .
这种双链RNA ,然后被加工成
小分子干扰核糖核酸由dcl3 .
该rdr2和rdp1突变,也
受长期的RNA ,由小分子干扰核糖核酸基因位点.
然而,相反的影响,对小分子干扰核糖核酸,
长期的RNA更为丰富,在沉默
突变体.因此, atsn1 RNA的更多
丰富的,在nrpd1a和rdr2突变体比
在野生型植物（图3 C ）条,显示
他们不是油料四誊本.据推测,这
RNA的结果必须由RNA聚合酶三
转录（ 10 ） atsn1是沉默
该油料四- rdr2 - dcl3通路在野生型
植物.我们无法侦测,只要油料四
誊atsn1是推测这是因为
他们目前只是非常低的数额和
都是蒙面更丰富的RNA产生
其他的RNA聚合酶.
该油料四- rdr2 - dcl3通路相关
与第2组和2002年的siRNAs并不要求
ago4或DNA甲基化（ 3 ） .然而,
该atsn1和1003点是hypermethylated
在野生型植物相对向nrpd1a万亩
www.sciencemag.org科学卷308 2005年4月1日
报告
图. 3 .分子指标的沉默. （一）北部的分析里9日,九仓;巷10 nrpd1a - 3泳道11 , nrpd1a - 4 ; lane12 , nrpd2a - 1泳道13
内源性小RNA ：车道1日至8日, gxa （ C24为）背景;车道9日至nrpd2b - 1 .污点被剥夺和reprobed成倍增长. （二）南区
13 ,中校- O的背景. 1行,每克;巷2 , rdr2 - 3线3条和第4 ,两个分析五常rDNA的重复序列在nrpd1a一系列等位基因消化后,与
独立rdr2 - 3 rdr2p ： ： rdr2 T2合资格线;巷5 , nrpd1a -1 ;车道6and 7 ,甲基化敏感性酶hpaii . （三） RT - PCR分析的内源性
两个独立nrpd1a - 1 nrpd1ap ： ： nrpd1a T2合资格线;巷8 nrpd1a - 2 ; atsn1誊是高架在rdr2 - 2和nrpd1a突变体.
tants （ 2 ） （图3B ）条中,并积累自己
的siRNAs是依赖于argonaute蛋白
ago4 ,从头DNA甲基转移酶
drm1 anddrm2 （五日,十一日,十二日） ,以及油料
四, rdr2 , dcl3 .在这些例子中,它
看来,我们已建议在第pombe
（ 13 ） ,即维持沉默涉及
自我强化沉默通路在其中
油料四介导的siRNA生产是依赖
关于ago4介导的DNA甲基化
反之亦然.
theroleofpol四所述herecould
解决的一个悖论染色质沉默
机制是依赖于RNA的.如果
该沉默的基因转录是由一个单一的
聚合酶,这种RNA依赖的机制
不会稳定,因为镇压
转录从这些位点
也将导致亏损沉默的RNA .
然而,沉默特异性聚合酶像
油料四,可耐染色质或DNA
修改影响聚合酶一至三
等,可以稳定地保持沉默
状态.在动物和真菌的油料四分支
缺席的,但沉默的悖论可能
解决了,如果有形式的核糖核酸
聚合酶一至三与沉默-具体
亚基,使转录的异染色质
,因此,维修
该RNA依赖的沉默.
最后一点,一般约沉默
机制是说明了GFP的跨
基因沉默与内源性24新台币的siRNA
沉默的通路都是依赖
对共和联盟蛋白质（图1018 ） .在玫瑰叶子
该植物的,这两个沉默途径
是相互独立的,因为跨
基因沉默是不受rdr2 （图1018 ）
由于内源性24nt的siRNA坚持
在rdr6植物（ 2 ） .然而,在这些花朵
通路是相互依存的,因为绿色荧光蛋白
沉默是受两rdr2和rdr6 .
这种潜在的沉默通路互动,
结合自己的能力,以形成
反馈和自我加强的循环（ 14 ） ,说明
潜在的复杂性内源性
监管网络涉及的siRNAs .
参考文献及债券
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15 .作者承认资金来自盖茨比
慈善基金会,生物技术和生物
科学研究委员会,以及婴儿,校
威康基金（ a.j.h. ）以及技术
援助的影响.
支持在线材料
www.sciencemag.org/cgi/content/full/1106910/dc1
材料与方法
无花果.中一至中四
表S1和S2
参考文献及债券
2004年10月29日;接受, 2005年1月25日
在网上公布2005年2月3日;
10.1126/science.1106910
包括这方面的资料时,引用这个文件.
平移算子的基因
对核糖体：如何抑制物
蛋白质排除核糖体约束力
lasse詹纳, 1帕斯卡romby , 2伯纳德里斯, 1
克莱门斯舒尔策- briese ,三是学生,施普林格, 4 chantal ehresmann , 2
伯纳德ehresmann , 2人Dino moras , 1 gulnara yusupova , 1
赛yusupov1 , 2 *
核糖体的热嗜热是cocrystallized与发起人转让
核糖核酸（ tRNA分子）和一个结构完整信使核糖核酸（ mRNA的）携带一个平移
运营商.道路mRNA的定义是在5.5埃决议
它比较,无论是与晶体结构相同的核糖体复杂
缺乏表达或联同非结构化mRNA的表达.一个确切核糖体环境
岗位操作者的茎环结构垂直于表面的
核糖体在该平台上的30年代亚基.有约束力的操作者和
首倡者的tRNA发生于核糖体与一个无人居住的tRNA撤离现场,
这是预期为起始复杂.定位监管
域的经营者相对核糖体阐明了分子
机制,即约束抑制物开关过翻译.我们的数据
建议一般以何种方式表达控制元素必须放在了
核糖体,以履行自己的监管任务.
起始翻译一般认定时,应变能力快的需要.有约束力的
效率促进蛋白质的合成,是eubacterial核糖体涉及的几个要素
关键的一步,为控制基因表达的基因,其中影响动力学的研究
2005年4月1日第一卷308科学www.sciencemag.org
希望能和你成为朋友