请略解释下数字表达谱(DGE)相比于基因表达谱芯片的区别?优势?如果可以的话,稍微讲解下两个的基本原理.我不是很懂,我的基本理解是:芯片:就是对已知的基因去在case与control组之间做
来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/11/18 04:41:00
请略解释下数字表达谱(DGE)相比于基因表达谱芯片的区别?优势?如果可以的话,稍微讲解下两个的基本原理.我不是很懂,我的基本理解是:芯片:就是对已知的基因去在case与control组之间做请略解释下
请略解释下数字表达谱(DGE)相比于基因表达谱芯片的区别?优势?如果可以的话,稍微讲解下两个的基本原理.我不是很懂,我的基本理解是:芯片:就是对已知的基因去在case与control组之间做
请略解释下数字表达谱(DGE)相比于基因表达谱芯片的区别?优势?
如果可以的话,稍微讲解下两个的基本原理.
我不是很懂,我的基本理解是:
芯片:就是对已知的基因去在case与control组之间做杂交,以分析表达差异?(好像这个不涉及到转录组测序吧,无非就是和探针的杂交,与southern\northern 类似?)
而DGE的话:是对某一状态的所有转录本进行测序,无所谓什么已知或未知的基因。(话说测序怎么看丰度,测序不只是能测到序列而已嘛?呵呵)。
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最大的区别是:芯片上的探针都是固定已知的.只是用不同样本的RNA杂交然后比较差异的表达谱,芯片跟测序是两个概念,原理就是杂交.
DGE测序可以得到某一状态下的所有转录本的表达谱,比芯片覆盖的范围要大.目前的测序前的建库都有个PCR扩增步骤,所以会有个信号放大的过程,一个序列被测到一次这个基因的丰度就是1,测到100次丰度就是100,因此每个基因的丰度是不同的.DGE也即是说把基因的表达谱用数字化直观的表示出来.你可以再了解了解~
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