自然界分离出一个新菌株怎么确定一个菌株是新种
来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/09/09 09:50:15
自然界分离出一个新菌株怎么确定一个菌株是新种自然界分离出一个新菌株怎么确定一个菌株是新种自然界分离出一个新菌株怎么确定一个菌株是新种第一步,扩增16s序列,比对数据库已定种的序列,一般相似度低于97.
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第一步,扩增16s序列,比对数据库已定种的序列,一般相似度低于97.5%视为疑似新种.
第二步,获得16s全长序列,构建系统发育树.
第三步,根据系统发育树选择对比的若干标准菌株.
第四步,结合标准菌株的定种文献,测定限制因子、生理生化、形态学、遗传学分析等各类指标,并与标准菌株比较,如有足够多的不同之处,以此可以判定为新种.
该过程称为多相分类学研究.
应该需要基因工具吧....
16S rDNA测序,某些保守序列测序,在NCBI上比对确定属。
与属内的每个种的标准菌株进行DNA杂交,杂交率小于70%,还有测复性温度
全细胞可溶性蛋白SDS—PAGE,碳源使用,氮源使用,酶图谱
很多东西。。。。
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