生物学中选择压力的计算我是研究艾滋病毒的,前面做了一些基础性的工作,现在转到了进化上,目前的研究问题是想看看一个病人体内的种种病毒随着时间的推移其承受的选择压力的变化情况.
来源：学生作业帮助网 编辑：六六作业网 时间：2024/12/25 17:01:09
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生物学中选择压力的计算我是研究艾滋病毒的,前面做了一些基础性的工作,现在转到了进化上,目前的研究问题是想看看一个病人体内的种种病毒随着时间的推移其承受的选择压力的变化情况.
生物学中选择压力的计算
我是研究艾滋病毒的,前面做了一些基础性的工作,现在转到了进化上,目前的研究问题是想看看一个病人体内的种种病毒随着时间的推移其承受的选择压力的变化情况.我们采集了单个病人不同时间点的病毒序列样本,现在想做以上分析,不太会,知道这里高手云集,知道可以应用的软件有PAML和datamonkey,我用他们做单个选择位点的确定还可以,然而这样又不能作为衡量整体上所受选择压力的指标.我金币不多,所以悬赏有限,如果可以,我到时再充电话费答谢.
生物学中选择压力的计算我是研究艾滋病毒的,前面做了一些基础性的工作,现在转到了进化上,目前的研究问题是想看看一个病人体内的种种病毒随着时间的推移其承受的选择压力的变化情况.
不太了解你需要做的“选择压力”的设计是什么.按说选择压力计算应该是在一个参考和一个对照之间才对.比如你选择了初始时间的病毒序列作为参照,比较此后各个时间节点的病毒序列与对照之间的序列变异,并计算选择压力?PAML应该可以很方便的计算Ka/Ks值,这应该可以作为选择压力的一个衡量,同时还有个不很确定的信息,即PAML应该也能够进行分组计算,即将参考对照材料分成两组,看待测材料与两组对照之间的选择压力（或进化速度）是否相同.
生物学中选择压力的计算我是研究艾滋病毒的,前面做了一些基础性的工作,现在转到了进化上,目前的研究问题是想看看一个病人体内的种种病毒随着时间的推移其承受的选择压力的变化情况.
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