如何理解DNA微卫星?
来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/12/25 22:10:28
如何理解DNA微卫星?
如何理解DNA微卫星?
如何理解DNA微卫星?
卫星DNA(satellite DNA)是一类高度重复序列 DNA在介质氯化铯中作密度梯度离心,离心速度可以高达每分钟几万转;此时DNA分子将按其大小分布在离心管内不同密度的氯化铯介质中,小的分子处于上层,大的分子处于下层;从离心管外看,不同层面的DNA形成了不同的条带.根据荧光强度的分析,可以看到在一条主带以外还有一个或多个小的卫星带.这些在卫星带中的DNA即被称为卫星DNA,这种DNA的GC含量一般少于主带中的DNA,浮力密度也低.
卫星DNA按其浮力密度的大小可以分成I、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四类,其浮力密度分别是1.687,1.693,1.697和1.700 g/cm3.各类卫星DNA都是由各种不同的重复序列家族所组成.卫星DNA通常是串联重复序列.卫星DNA按其重复单元的核苷酸的多少,可以分为两类.一类是小卫星DNA(minisatellite DNA),由几百个核苷酸对的单元重复组成.另一类是微卫星DNA(microsatellite DNA),由2个到20个左右的核苷酸对的单元重复成百上千次所组成.卫星DNAI家族由42bp的单元组成,其中17bp(ACATAAAATAT AAAGT)为可变区,25 bp(ACCCAAAAAGT TATTATATACTGT)为重复单元.卫星DNAⅡ家族是保守性差的ATTCC重复.卫星DNAⅢ是较保守的ATTCC重复,且与10bp的序列(A TCGGGTTG)相间分布.卫星DNA还有另一些分类的名称,如α卫星DNA是灵长类特有的单元为171 bp的高度重复序列,最初是在非洲青猴基因组中发现,现在已确定分布在人染色体的着丝粒区.β卫星DNA家族是单元为68bp的串联重复序列,富含GC.γ卫星DNA是220 bp的串联重复.第Ⅳ类卫星DNA称为隐藏的卫星DNA(cryptil satellite).这是包含了多种串联重复序列的DNA分子,离心时并不像卫星DNA那样也分开,但它的属性却类似卫星DNA.