【求助】如何计算前线分子轨道电荷密度?
来源：学生作业帮助网 编辑：六六作业网 时间：2024/11/21 22:20:31
【求助】如何计算前线分子轨道电荷密度?
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【求助】如何计算前线分子轨道电荷密度?
如果是的话,这个iso-value在用GaussView画图的时候就有显示,注意看一下那个小窗口.HOMO/LUMO图的默认iso-value是0.02,电荷密度的话你再看一下.recoli(站内联系TA)文献里写单位是a.u..具体应该是电子电荷除以波尔半径的三次方.zhou2009(站内联系TA)G03的cubegen不能作某个MO的ρ,将某个MO的cube输入到cubman也不能作平方运算作成ρ,因为cubman缺少平方运算.
这时,可以运行cubegen,回答：
Property ? HOMO（或者LUMO）
即得到HOMO的空间格点文件.
将此文件进入gsgrid程序,对这格点数据进行平方,再乘以2（两个电子占据这个轨道时）,即得到该MO的电子密度.然后再进入绘图程序作图.
进入gsgrid程序时,最好先选择一个该MO的最有代表性的截面,再作平方等,这样可以用sigmaplot作出该MO电子密度的等值线来.
但是由于电子密度是MO的平方,是没有了相位的,讨论前线分子轨道问题,还是要看HOMO、LUMO,特别是看它们的对称性、相位是否相符.sculhf(站内联系TA)Originally posted by zhou2009 at 2009-8-1 09:15:
G03的cubegen不能作某个MO的ρ,将某个MO的cube输入到cubman也不能作平方运算作成ρ,因为cubman缺少平方运算.
这时,可以运行cubegen,回答：
Property ? HOMO（或者LUMO）
即得到HOMO的空间 ... 我觉得评审人的意思应该是电子密度而不是电荷密度你认为呢?电子密度是定义各个轨道上分布的电子数,通常的密度矩阵就是表达这个的.
而电荷密度,表示原子上有多少净电荷.
电子密度针对轨道,电荷密度针对原子的zhou2009(站内联系TA)你说“电子密度针对轨道,电荷密度针对原子的”,“电荷密度,表示原子上有多少净电荷.”我也是这样认为的.
你说“电子密度是定义各个轨道上分布的电子数,通常的密度矩阵就是表达这个的.”我也是这样认为的.
我还认为cube截面也是在用另一种方式表达轨道上分布的电子密度.
二者相比较,密度矩阵除了说分子中原子的实有电子外,还有重叠密度,再加上现在基组众多,σ、π、pi（孤对电子）会重叠在一个原子上,密度矩阵实在不易分析,影响了密度矩阵的正确表征能力.
至于原子上有多少净电荷,至今没有一个合用的计算方法,结果常常不合理、不合用.
原子的净电荷是从密度矩阵计算的,它均分了重叠密度,这样就带入了人为处理的因素,许多时候这种处理会显得极不合理.
cube截面表示的电子密度,没有人为处理因素,为原始的一手信息.只是它需要借助图形展示,不能用离散的数字说明.recoli(站内联系TA)Originally posted by sculhf at 2009-8-1 13:30:
我觉得评审人的意思应该是电子密度而不是电荷密度你认为呢?电子密度是定义各个轨道上分布的电子数,通常的密度矩阵就是表达这个的.
而电荷密度,表示原子上有多少净电荷.
电子密度针对轨道,电荷密度针 ... 审稿人的问题要看上下文的,这个只有你自己知道了.但既然提到了iso-surface和前线轨道,那么我猜审稿人是在问HOMO/LUMO的isovalue值.这个值在GaussView里是可调的,调小了轨道看起来就比较弥散,调大了轨道看起来就比较紧凑.sculhf(站内联系TA)Originally posted by zhou2009 at 2009-8-1 15:09:
你说“电子密度针对轨道,电荷密度针对原子的”,“电荷密度,表示原子上有多少净电荷.”我也是这样认为的.