您好,我想问一下实时荧光定量pcr的数据分析!我有普通组,实验组1,实验组2,三个组,既要检测这三个组中每个组不同部位之间是否有差异,也要比较这三组中同一部位之间是否有差异,用2-△△ ct
来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/11/08 17:05:46
您好,我想问一下实时荧光定量pcr的数据分析!我有普通组,实验组1,实验组2,三个组,既要检测这三个组中每个组不同部位之间是否有差异,也要比较这三组中同一部位之间是否有差异,用2-△△ ct
您好,我想问一下实时荧光定量pcr的数据分析!
我有普通组,实验组1,实验组2,三个组,既要检测这三个组中每个组不同部位之间是否有差异,也要比较这三组中同一部位之间是否有差异,用2-△△ ct法算的话,应如何算?对于每组不同部位的比较的话,将其中一个处理为1进行比较吗?那对于三个组中的同一部位的比较的话,难道也要将其中一组处理为1吗?我不太清楚,看文献也没怎么看懂,希望大侠不吝赐教,
您好,我想问一下实时荧光定量pcr的数据分析!我有普通组,实验组1,实验组2,三个组,既要检测这三个组中每个组不同部位之间是否有差异,也要比较这三组中同一部位之间是否有差异,用2-△△ ct
用2-△△ ct法算的话,应如何算?
假设检测A基因,CT分别为(这里记住CT越大,表明相对含量越低)
普通组/Test1:28
实验组1/Test2:29
实验组2/Test3:30
这时候要设对照了,假设Test1为对照组(普通组),当然是以普通组为对照
那么,相对含量为:
普通组/Test1:1
实验组1/Test2:2^-(28-29)=1/2=0.5
实验组2/Test3:2^-(28-30)=1/4=0.25
A基因在实验组1和实验组2中的表达量,分别下降2倍和4倍!
所以,就出来啦,结果
对于每组不同部位的比较的话,将其中一个处理为1进行比较吗?
如
实验组1
Testis
Brain
Liver
Muscle
可以把任何一个作为1,作为对照,但是要在figure 的legend中注明出来,说清楚就好了!
那对于三个组中的同一部位的比较的话,难道也要将其中一组处理为1吗?
是的,可以,如
Brain
普通组/Test1
实验组1/Test2
实验组2/Test3
就以普通组/Test1,为对照组,设为1,其他为相对含量,也要在figure 的legend中注明出来说清楚!
这个很简单。你把普通组的某个部位的相对量设为1。其他的,不管是组内的,还是组间的,都用△△ct的方法算出相对量。再进行比较。基本概念就是设一个点为基点,其他的都是相对值。不要每比一次都设一个1。再麻烦您一下,就拿我的这个实验而言,普通组是没有添加任何东西的,实验组1添加了A物质,实验组2添加了B物质,看其心,肝,脾,肺,肾这5个组织的表达差异,如您所说的话,我将普通组的心处理为1(即△△ ct=0...
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这个很简单。你把普通组的某个部位的相对量设为1。其他的,不管是组内的,还是组间的,都用△△ct的方法算出相对量。再进行比较。基本概念就是设一个点为基点,其他的都是相对值。不要每比一次都设一个1。
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