想确切的知道PCR-DGGE的意义,是要先把DNA或RNA体外扩增,然后鉴定菌种吗?还有就是分析细菌为什么用16SrRNA而不用DNA呢?
来源：学生作业帮助网 编辑：六六作业网 时间：2024/12/26 04:47:03
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想确切的知道PCR-DGGE的意义,是要先把DNA或RNA体外扩增,然后鉴定菌种吗?还有就是分析细菌为什么用16SrRNA而不用DNA呢?
想确切的知道PCR-DGGE的意义,是要先把DNA或RNA体外扩增,然后鉴定菌种吗?还有就是分析细菌
为什么用16SrRNA而不用DNA呢?
想确切的知道PCR-DGGE的意义,是要先把DNA或RNA体外扩增,然后鉴定菌种吗?还有就是分析细菌为什么用16SrRNA而不用DNA呢?
1、关于鉴定菌种问题：确切的说PCR-DGGE不能准确鉴定细菌至种属,只能达到门、纲的水平.因为DGGE的最适片段长度不超过500bp,这个长度不足以精确鉴定.
2、关于其意义：DGGE用于区别相同长度的基因片段是否存在碱基突变（碱基差异）.例如你扩增大肠和沙门的16S 的V3区,产物均为200bp左右,用普通的电泳跑出来条带在同一位置,混合在一起,在一个泳道跑的话就只有一条带,但是用DGGE跑出来就是两条带,因为两个物种的V3区序列有差异.DGGE现在的用途有：区别两个以上的基因是否存在突变；基因多态性分析.
3、关于为什么不用细菌基因组DNA,而用16S rRNA：根据你的提问,估计你是要分析微生物群落的多样性.16S能用于细菌种属鉴定,是因为其序列具有种属特异性,16S又可进一步划分为多个区域,这些区域有保守性的,也有可变区.在DGGE中,常用16S的可变区V3区或V6区来进行分析.可变区在不同的种属间存在差异,所以可以通过DGGE分开.不用其他DNA,可能因为大小不适合DGGE,也可能是因为序列差异性不适合DGGE,还可能是因为不同细菌的该基因大小不一样,用DGGE就没意义了.
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