求问:分子生物学中Contig的含义?在某paper中看到的,标题是PCR,Sequencing,and Contig Assembling这里的Contig的翻译,
来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/09/04 04:54:38
求问:分子生物学中Contig的含义?在某paper中看到的,标题是PCR,Sequencing,and Contig Assembling这里的Contig的翻译,
求问:分子生物学中Contig的含义?
在某paper中看到的,标题是PCR,Sequencing,and Contig Assembling
这里的Contig的翻译,
求问:分子生物学中Contig的含义?在某paper中看到的,标题是PCR,Sequencing,and Contig Assembling这里的Contig的翻译,
contig就是重叠群的意思.就是基因组分析测序中的一个概念.
把含有STS序列标签位点的基因片段分别测序后,重叠分析就可以得到完整的染色体基因组序列.分析中的用到的一个概念就是重叠群.
物理图谱的制作,可以更好的理解这个概念:
基本原理是把庞大的无从下手的DNA先“敲碎”,再拼接.以Mb、kb、bp作为图距,以DNA探针的STS(sequence tags site)序列为路标.1998 年完成了具有52,000个序列标签位点(STS),并覆盖人类基因组大部分区域的连续克隆系的物理图谱.构建物理图的一个主要内容是把含有STS对应序列的DNA的克隆片段连接成相互重叠的“片段重叠群(contig)”.用“酵母人工染色体(YAC)作为载体的载有人DNA片段的文库已包含了构建总体覆盖率为100%、具有高度代表性的片段重叠群”,近几年来又发展了可靠性更高的BAC、PAC库或cosmid库等.
contig最初的解释只是代表鸟枪法打下的一个read,即一个克隆片段。明明翻译为重叠群,为什么刚开始只代表一个克隆片段呢?是因为每个片段在拼接时都是像打补丁一样把不完整的地方补齐,这也就意味着有许多重叠,每个片段作为重叠的一部分,就被叫做a config了。后来,config引申为大家容易理解的相邻的重叠克隆片段拼接好的序列。...
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contig最初的解释只是代表鸟枪法打下的一个read,即一个克隆片段。明明翻译为重叠群,为什么刚开始只代表一个克隆片段呢?是因为每个片段在拼接时都是像打补丁一样把不完整的地方补齐,这也就意味着有许多重叠,每个片段作为重叠的一部分,就被叫做a config了。后来,config引申为大家容易理解的相邻的重叠克隆片段拼接好的序列。
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