perl 计算氨基酸对的频率 我的源文件seq如下:现在要做如下处理,计算每一行间隔为k的氨基酸对出现的频率.比如,第一行,间隔为三(k=3)的氨基酸对是,NR,GT,LQ,IT,需要统计这么些个氨基酸对出

来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/11/28 17:14:31
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perl 计算氨基酸对的频率
我的源文件seq如下:

现在要做如下处理,计算每一行间隔为k的氨基酸对出现的频率.比如,第一行,间隔为三(k=3)的氨基酸对是,NR,GT,LQ,IT,需要统计这么些个氨基酸对出现的频率并输出.总次数很好算,直接利用length($seq)-k-1.
可是,我没有办法统计氨基酸对出现的次数,还是举第一行的例子,就是我没很好的办法实现统计NR出现过几次,这样我就没法计算NR对出现的频率了

perl 计算氨基酸对的频率 我的源文件seq如下:现在要做如下处理,计算每一行间隔为k的氨基酸对出现的频率.比如,第一行,间隔为三(k=3)的氨基酸对是,NR,GT,LQ,IT,需要统计这么些个氨基酸对出
#!/usr/bin/perl
use strict;
use warnings;
open (IN, "amin.txt"); ##输入文件
open (OUT,">result.txt"); ##输出文件
my $k=3;
print OUT "Row_Number\tAmino-acid-pair\tcounts\n"; ##结果文件格式 行 氨基酸对 本行出现次数
my %amin;
my $line=1;
while(){
chomp;
my $seq=$_;
for(my $i=0;$i

perl 计算氨基酸对的频率 我的源文件seq如下:现在要做如下处理,计算每一行间隔为k的氨基酸对出现的频率.比如,第一行,间隔为三(k=3)的氨基酸对是,NR,GT,LQ,IT,需要统计这么些个氨基酸对出 如何用perl读入一个文件,计算文件中各个单词的出现频率,再输出用perl读入一个文件shizegengo.txt,计算文件中各个单词的出现频率,然后再按左边-单词,右边-出现次数perl -w# frequency%count;open TERM, 求perl的统计程序,统计病毒序列中的ATCG总数,以及各个核苷酸所占比例【病毒DNA中有四种核苷酸,即ACTG】我有从网站下载的源文件HA.fa,并且从中提取了时间和病毒序列放置到excel表格中了,时间 用perl查一个词表中的词在另一个文档中出现的,频率,输出频率表,并列出该词出现的索引行.我现在有一个词表文件,里面有十几个词,还有一篇已经分好行的一句一句的文章,要用perl写个程序算 有关氨基酸的计算, 如何用perl编写程序计算数学公式,比如计算键盘输入数字的log值 perl中统计单词出现频率的一段代码,大家帮我看看我那里错了?/usr/bin/perl open(MY,1.txt);while(){while(/fred/){$words {$1}++;} }foreach $_ (keys %words){print $_$words{$1} ;}我的txt文本是fredbarneyfreddinowilmafred perl语言中遇到的情况 perl 中$::的含义及用法 多对同源染色体的 基因频率的计算 已知AA基因型频率0.2Aa基因型频率0.6aa基因型频率0.2求A的基因频率为什么不能直接对AA基因型频率开方计算 高中生物有关氨基酸的计算, “旋转”的“转”读几声?我在下载时,提示源文件不可读或无法复制,是怎么原因? perl $$含义想知道perl中$$表示的是什么意思if ($keyname /DEVICE_SUPPORT/i){$device = $${keyname};} 氨基酸对肌肤的作用 电磁波的频率计算公式 样本的频率怎样计算? 如何计算电路的频率