染色质免疫共沉淀技术Chromatin Immunoprecipitation能做什么用?

染色质免疫共沉淀技术Chromatin Immunoprecipitation能做什么用?
染色质免疫共沉淀技术Chromatin Immunoprecipitation能做什么用?

染色质免疫共沉淀技术Chromatin Immunoprecipitation能做什么用?
细 胞 内有 许 多 调 节 机制 都 是通 过 蛋 白质 的转 录后
修饰 、蛋 白质之间的相互作用 、蛋 白质与 DNA间 的相
互 作 用 等 瞬时 又 严 谨 的变 化 来 实 现 的 .甲醛 作 为 固定
剂 ．就 好 比是 染 色质 瞬时 事 件 的摄 相 机 ,免疫 沉 淀 又 能
通 过 合 适抗 体 的选 择 富 集 特 异 的 目的 蛋 白及 相 关
DNA．而基 因序 列 的 富集 更 为重 要 .所 以 甲醛 交 联及 染
色质 免疫 沉淀 的方法 ．开创 了 DNA一蛋 白质 体 内 相互 作
用研究的新时代 .随着染 色质研究兴趣 的提 高及高滴
度 、高特异性蛋 白质抗体的获得 ．甲醛交联及染色质免
疫 沉 淀 方法 已成 功 用 于研 究 染 色 质 结构 和染 色 质 动 力
学 等不 同的领 域 中 .研究 对 象涉 及 酵母 、原 虫 、果 蝇 、人
体 细 胞 以 及古 细 菌 等 多 种生 物 ； 内容 集 中在 与 染 色 质
直 接 相 关 的蛋 白质 ；范 围包 括 细 胞信 号 通 路 ,转 录调 节
与 组蛋 白修饰 的关 系 ．古 细 菌核 小体 的组成 等 .更 为重
要 的是 ．该技 术 已在研 究 体 内含 量 远 小 于组 蛋 白的其 他
DNA结 合蛋 白或 复合物 中获得成 功 .例 如 ．果蝇 中
POLY—CO 的基 因组结 合 蛋 白 ,哺乳 动物 T细 胞 和 B
细 胞 发 育 中 ,IKAROS／HELIOS家 族 成 员 与 中 心 粒 异 染
色 质 区静 默基 因 的关 系 .近来 该 方 法 又取 得 了突 破性
的进展 ．用 于 分 析转 录 因子 与 内源 基 因的 体 内结 合 ,打
破 了 以往 必 须 依 赖 体 外 方 法 寻 找 转 录 因子 的 DNA结
合序列的局 限.2000年 Ren等发展 了芯片方法 ．检测基
因组水 平 上 染 色 质蛋 白 的定 位 分 析 ．这 使 得 甲醛 交联
及染 色 质 免疫 沉淀 技 术 的应 用更 加方 便 、快 速 .
随 着 功 能 基 因组 学 研 究 的 深 人 开 展 ．在 染 色 质 水
平 研 究 基 因 的 表 达 调 控 是 全 面 阐 明 真 核 基 因表 达 调
控 机 制 的必 经 之 路 .染 色 质 免 疫 沉 淀 技 术 不 仅可 以检
测体 内反 式 因子 与 DNA 的动 态 作 用 ,还 可 以用 来 研 究
组蛋 白的各种共价修饰与基 因表达的关系.而且,染色
质 免疫沉淀技术与其他方 法的结 合 ,扩大 了其应用范
围 与 基 因 芯 片相 结 合 所 建 立 的 ChIP—onchip方 法 已
广 泛用于特定反式因子靶基 因的高通量筛选 ；与体 内
足 迹 法 相 结 合 ,用 于 寻 找 反 式 因 子 的 体 内结 合 位 点 ；
RNA—ChIP用 于 研 究 RNA 在 基 因表 达 调 控 中 的 作 用
等等.由此可见,随着 ChIP的进一步完善 ,它必将会在
基 因表 达 调 控 研 究 中发 挥 越来 越 重 要 的作 用 .

染色质免疫沉淀技术（chromatin immunoprecipitation assay, CHIP）是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。ChIP不仅可以检测体内反式因子与DNA的动态作用，还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰与基因表达的关系。研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径。
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详见：http://baike....

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染色质免疫沉淀技术（chromatin immunoprecipitation assay, CHIP）是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。ChIP不仅可以检测体内反式因子与DNA的动态作用，还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰与基因表达的关系。研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径。
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详见：http://baike.baidu.com/view/1485211.htm#sub1485211

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