测序过程中反应数怎么算?一般正向测序和反向测序算一个反应,双向算两个反应,测通怎么算?什么样的seq需要测通?为什么测序过程中一个反应按800bp算?而不是按600,700?这个800bp是怎么得来的?

来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/12/23 11:51:57
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测序过程中反应数怎么算?
一般正向测序和反向测序算一个反应,双向算两个反应,测通怎么算?什么样的seq需要测通?为什么测序过程中一个反应按800bp算?而不是按600,700?这个800bp是怎么得来的?

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测序的结果好坏由您的样品和测序技术决定的,ABI的3730XL测出的结果好的话有效长度在800左右,所以测序过程中一个反应按800bp算
测通怎么算:测通就是给您的样品序列都测出来,您的样品只有700bp,那一个反应就可以了
比如您的样品有1500bp,那么样品好的话正反两个方向就测通了.
如果您的样品有5k 样品好的话大概要7,8个反应,应为拼接时候两个反应间还要有一个重合度的问题
注意这里说的测通不包含您的引物序列,若要引物序列,还要加反应

模板量是不是就是开始加入的目的DNA的量,因为双脱氧法是要求DDNTP随机渗入简单说一下:模板DNA就是你要测定的DNA片断;引物在测序反应中与模板DNA特异

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