谁能告知下有木有关于基因测序拼接的原理的文章（中英都行）除了一二代测序原理,我还想知道那些什么contigs、scafford等是怎么拼接的,这是生物信息的内容吧,能介绍几篇文章吗?
来源：学生作业帮助网 编辑：六六作业网 时间：2024/11/25 10:40:19
谁能告知下有木有关于基因测序拼接的原理的文章（中英都行）除了一二代测序原理,我还想知道那些什么contigs、scafford等是怎么拼接的,这是生物信息的内容吧,能介绍几篇文章吗?
谁能告知下有木有关于基因测序拼接的原理的文章（中英都行）
除了一二代测序原理,我还想知道那些什么contigs、scafford等是怎么拼接的,这是生物信息的内容吧,能介绍几篇文章吗?
谁能告知下有木有关于基因测序拼接的原理的文章（中英都行）除了一二代测序原理,我还想知道那些什么contigs、scafford等是怎么拼接的,这是生物信息的内容吧,能介绍几篇文章吗?
contigs的意思是：将邻接片段部分覆盖并连接起来；即染色体片段的克隆,两个片段通过有重叠部分推断出两者相互邻接,逐步把它们拼接起来形成序列更长的重叠群.这是通过一些拼接软件来实现的,例如：DNASTAR等；软件的使用说明请参阅：http://clouds7.blog.163.com/blog/static/1804760752011530113424347/
基因组中的scaffold是：将可以拼接的片段经过重叠拼接后形成contigs,若干的contigs根据另外的酶切信息或其他可以作为“路标”的标记信息而拼接,可以形成各个contig在染色体上的线性排列或是相对位置关系,这样的排列就形成了scaffold.换言之,scaffold是众多的contig拼接结果.
那么片段拼接到什么程度才能算是一个scaffold呢?这个应该没有定值,根据实验目的确定不同的严谨度,跟contig的拼接是类似的.
http://genome.jgi-psf.org/help/scaffolds.html
类似的资料网上有很多，遇到不认识的英文词，google一下~