DHPLC能应用于检测土壤微生物的多样性吗?我看到DHPLC的灵敏度要高过DGGE,就不知道能不能应用于分子生态学,尤其是土壤微生物DNA的检测,需要什么样的前处理,另外我找不到相关的文献报道,有
来源：学生作业帮助网 编辑：六六作业网 时间：2024/12/19 17:29:29
DHPLC能应用于检测土壤微生物的多样性吗?我看到DHPLC的灵敏度要高过DGGE,就不知道能不能应用于分子生态学,尤其是土壤微生物DNA的检测,需要什么样的前处理,另外我找不到相关的文献报道,有
DHPLC能应用于检测土壤微生物的多样性吗?
我看到DHPLC的灵敏度要高过DGGE,就不知道能不能应用于分子生态学,尤其是土壤微生物DNA的检测,需要什么样的前处理,另外我找不到相关的文献报道,有报道的全是关于动植物的.
能否再详细一点,我已看到文献国外有研究小组在做这方面工作,如果做微生物功能基因的话,目前知道的片段也不是太大啊,而且现在做土壤微生物多样性的多采用DGGE的方法,DGGE最大据说才能分离1000bp的片段,所以说DHPLC可能更有优势,而且做DGGE要先PCR的.就因为土壤比较复杂,所以不知道做了效果如何,如果好的话可以考虑让实验室买仪器,因为国内好像没有什么人在做吧,如果有可能浙大在做.
DHPLC能应用于检测土壤微生物的多样性吗?我看到DHPLC的灵敏度要高过DGGE,就不知道能不能应用于分子生态学,尤其是土壤微生物DNA的检测,需要什么样的前处理,另外我找不到相关的文献报道,有
理论上是可以的,但是前处理实在是问题太多,关于前处理现在在国际上都快成分析化学和环境领域的独立分支了.关键是土壤微生物的复杂性以及生物活性的瞬间性,因为一般要分离,而且又要保持它的活性,否则就没有意义了.
DHPLC工作的三种操作模式：非变性模式按片段长度分离,与序列无关,部分变性和完全变性模式均依靠片段大小和序列分离.而且不管单双链还有适用温度范围,DNA片段长度一般都小于2000bp.而土壤微生物本身就达到数十到上百种,所以操作起来很难.
土壤用PCR-DGGE是很成熟的,相反DHPLC看似精度高,但是仪器也娇贵,而且目前世界上用PCR-DGGE
的也不在少数,不知道你是探索新的方法还是没有搞过土壤微生物,想研究一下,我觉得把PCR-DGGE用好就相当厉害了,主要是这种方法更普遍,更具有公信力.