测序出现双峰为什么
来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/12/23 22:17:40
测序出现双峰为什么测序出现双峰为什么测序出现双峰为什么样品本身被污染,这常常发生在样品为质粒和菌液的情况中.当使用通用引物测序时,如果刚好和样品中的几个质粒均能结合,那么就会出现这种情况,而且在同一位
测序出现双峰为什么
测序出现双峰为什么
测序出现双峰为什么
样品本身被污染,这常常发生在样品为质粒和菌液的情况中.当使用通用引物测序时,如果刚好和样品中的几个质粒均能结合,那么就会出现这种情况,而且在同一位置上还可能有不止两个峰形;样品不是单一模板,这常常发生在样品为PCR产物的情况中.由于使用的是特异性引物,因此即使模板中有其他DNA的存在,产生干扰的可能性也很小.通常是由于存在两条分子量很接近,采用琼脂糖电泳无法分开的条带,在测序时就会发生这种情况;
样品中存在两个引物结合位点,这常常发生在样品中存在重复序列的情况下.当引物恰好设计在重复序列中时,那么在重复序列以外的部分就会出现Twopattern的情况;所用的测序引物不纯,这种情况一般发生在PCR产物测序中.因为PCR测序一般使用的都是PCR扩增引物,如果引物本身不纯,测序结果会出现双峰.所以我们测序的引物一般要求都是要经过PAGE纯化的;测序样品序列中存在如重复序列,poly结构,发夹结构等复杂结构导致测序信号出现乱峰.
发生了非特异性结合
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