医学英语分子生物学实验,英译汉Compare the cDNA sequence of 4 variants,there are only differences between exon3 and exon7,thus design specific primer for these two exons could differentiate 4 variants.1.total RNA extraction2.RT-PCR:primer
来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/11/28 13:34:28
医学英语分子生物学实验,英译汉Compare the cDNA sequence of 4 variants,there are only differences between exon3 and exon7,thus design specific primer for these two exons could differentiate 4 variants.1.total RNA extraction2.RT-PCR:primer
医学英语分子生物学实验,英译汉
Compare the cDNA sequence of 4 variants,there are only differences between exon3 and exon7,thus design specific primer for these two exons could differentiate 4 variants.
1.total RNA extraction
2.RT-PCR:
primer for exon3:Tm:about 52°C
sense primer:5' GATTGGACAGGCTGGACT 3'
anti-sense primer:5' AGAAGTGGTGGCAGTGATT 3'
predicted results:288bp product in Nurr1-a,b,c; no amplified product in Nurr1-d.
primer for exon7:Tm:58-59°C
sense primer:5' CCAAAGCCGACCAAGACC 3'
anti-sense primer:5' ATTATTGCTGGCGGTGGC 3'
predicted results:472bp product in Nurr1-a,d; 418bp product in Nurr1-b; 351bp product in Nurr1-c.
3.result analysis:
Nurr1-a Nurr1-b Nurr1-c Nurr1-d
amplication for exon 3 288bp 288bp 288bp no product
amplication for exon 7 472bp 418bp 351bp 472bp
4.
Problem:RefSeq for Nurr1-b,c,d have been permanently suppressed because of insufficient support.
医学英语分子生物学实验,英译汉Compare the cDNA sequence of 4 variants,there are only differences between exon3 and exon7,thus design specific primer for these two exons could differentiate 4 variants.1.total RNA extraction2.RT-PCR:primer
比较了四个变体的cDNA序列,它们只在外显子3和外显子7之间存在区别,因此可以通过设计针对这两个外显子的特殊引物来区别这四个变体.
1.总RNA提取
2.逆转录PCR
外显子3引物:熔解温度:约52℃
正向引物 5' GATTGGACAGGCTGGACT 3'
反向引物 5' AGAAGTGGTGGCAGTGATT 3'
预测结果:Nurr1-a,b,c产物大小288bp;Nurr1-d无产物
7号外显子引物:Tm:58-59°C
sense primer:5' CCAAAGCCGACCAAGACC 3'
anti-sense primer:5' ATTATTGCTGGCGGTGGC 3'
预测结果:Nurr1-a,d 472bp长的产物; Nurr1-b有418bp产物; Nurr1-c有351bp产物.
3.结果分析:
Nurr1-a Nurr1-b Nurr1-c Nurr1-d
扩增3号外显子 288bp 288bp 288bp 无产物
a扩增7号外显子 472bp 418bp 351bp 472bp
4.问题:Nurr1-b,c,d的RefSeq记录因为支持不足而被长期废止
比较4个不同的cDNA序列,只有3号和4号外显子有区别。所以在这2个外显子部位设计了针对可以区分这4个不同序列的引物
1,提取总RNA
2,RT-PCR
3号外显子引物,TM 大概52度
正向引物 5' GATTGGACAGGCTGGACT 3'
反向引物 5' AGAAGTGGTGGCAGTGATT 3'
预测结果: Nurr1-a,b,c产物大小...
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比较4个不同的cDNA序列,只有3号和4号外显子有区别。所以在这2个外显子部位设计了针对可以区分这4个不同序列的引物
1,提取总RNA
2,RT-PCR
3号外显子引物,TM 大概52度
正向引物 5' GATTGGACAGGCTGGACT 3'
反向引物 5' AGAAGTGGTGGCAGTGATT 3'
预测结果: Nurr1-a,b,c产物大小288bp;Nurr1-d无产物.
7号外显子引物: Tm: 58-59°C
sense primer: 5' CCAAAGCCGACCAAGACC 3'
anti-sense primer: 5' ATTATTGCTGGCGGTGGC 3'
预测结果: Nurr1-a,d 472bp长的产物; Nurr1-b有418bp产物; Nurr1-c有351bp产物.
3. 结果分析s:
Nurr1-a Nurr1-b Nurr1-c Nurr1-d
扩增3号外显子 288bp 288bp 288bp 无产物
a扩增7号外显子 472bp 418bp 351bp 472bp
4.
疑问: RefSeq for Nurr1-b,c,d 因为不足够的支持而被永久抑制
收起
一序列的比较,只有4个变量之间的差异,从而设计exon3和exon7具体底漆可以区分这两个子4变异。
总RNA提取准备
2。通过。
exon3底漆:提戈亚-蒙泰罗:约52摄氏度
意义:5 ' GATTGGACAGGCTGGACT底漆3 '
anti-sense底漆:5 ' AGAAGTGGTGGCAGTGATT 3 '
预测结...
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一序列的比较,只有4个变量之间的差异,从而设计exon3和exon7具体底漆可以区分这两个子4变异。
总RNA提取准备
2。通过。
exon3底漆:提戈亚-蒙泰罗:约52摄氏度
意义:5 ' GATTGGACAGGCTGGACT底漆3 '
anti-sense底漆:5 ' AGAAGTGGTGGCAGTGATT 3 '
预测结果:288bp产品在Nurr1-a、乙、丙、没有放大产品在Nurr1-d。
exon7底漆:提戈亚-蒙泰罗:58-59°C
意义:5 ' CCAAAGCCGACCAAGACC底漆3 '
anti-sense底漆:5 ' ATTATTGCTGGCGGTGGC 3 '
预测结果:472bp Nurr1-a产品,产品在Nurr1-b;418bp;351bp Nurr1-c产品。
结果分析:来讲
Nurr1-a Nurr1-b Nurr1-c Nurr1-d
我们amplication 288bp 288bp 3 288bp的产品
我们amplication 418bp 351bp为7 472bp 472bp
4。
问题:RefSeq为Nurr1-b、c、d已经永久地抑制,因为缺乏支持。
收起
将四组突变cDNA序列进行比较,发现仅仅在第3个外显子和第7个外显子出有区别,因此针对这两个外显子设计引物就能够区分这四个突变体。
1、 RNA的提取
2、 实时定量PCR
第3个外显子的引物:解链温度为52°C
正向引物序列:5' GATTGGACAGGCTGGACT 3'
反向引物序列:5' AGAAGTGGTGGCAGTGATT 3'
预期结果...
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将四组突变cDNA序列进行比较,发现仅仅在第3个外显子和第7个外显子出有区别,因此针对这两个外显子设计引物就能够区分这四个突变体。
1、 RNA的提取
2、 实时定量PCR
第3个外显子的引物:解链温度为52°C
正向引物序列:5' GATTGGACAGGCTGGACT 3'
反向引物序列:5' AGAAGTGGTGGCAGTGATT 3'
预期结果:Nurr1-a,b,c产物大小288bp;Nurr1-d无产物
第7个外显子的引物:解链温度为58-59°C
正向引物序列:5' CCAAAGCCGACCAAGACC 3'
反向引物序列:5' ATTATTGCTGGCGGTGGC 3'
预测结果: Nurr1-a,d 472bp长的产物; Nurr1-b有418bp产物; Nurr1-c有351bp产物.
3、结果分析
Nurr1-a Nurr1-b Nurr1-c Nurr1-d
扩增3号外显子 288bp 288bp 288bp 无产物
扩增7号外显子 472bp 418bp 351bp 472bp
4、Nurr1-b,c,d在RefSeq数据库中被永久消除,原因是没有充分的理论支持。
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