为什么引物3′端要避开密码子的第3位?不要告诉我说是简并性,百度百科里的我自己也会看.请详细解释.请告诉我假如没有避开,会出现什么情况.谢谢!

来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/11/18 00:17:00
为什么引物3′端要避开密码子的第3位?不要告诉我说是简并性,百度百科里的我自己也会看.请详细解释.请告诉我假如没有避开,会出现什么情况.谢谢!为什么引物3′端要避开密码子的第3位?不要告诉我说是简并性

为什么引物3′端要避开密码子的第3位?不要告诉我说是简并性,百度百科里的我自己也会看.请详细解释.请告诉我假如没有避开,会出现什么情况.谢谢!
为什么引物3′端要避开密码子的第3位?
不要告诉我说是简并性,百度百科里的我自己也会看.
请详细解释.
请告诉我假如没有避开,会出现什么情况.
谢谢!

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你或许可以参考下Crick据立体化学原理提出的摆动学说,该学说认为在密码子与反密码子的配对中,前两对碱基严格遵守碱基配对原则,但是第三对有一定的自由度,可以“摆动”,从而使某些tRNA可以识别一个或一个以上的密码子.在引物设计中,如果3′端在密码子的第3位,可能会形成错误的碱基配对,降低引物特异性,后果你应该很清楚了.

你应该是断章取义了,你看到的这条要求应该是专指在简并因物的设计中,而在普通引物设计中没有这条规则。
在普通引物设计中显然是多一个碱基会增加它的特异性。而简并引物是不知道dna序列只知道蛋白序列的情况下猜测dna序列,当然是要降低它的简并性。如果最后一个碱基(引物3‘)落在密码子第三位,那还不如去掉它,因为加上它会一下增加简并引物数量,或是降低特定引物的特异性
如果考虑引物tm值等不...

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你应该是断章取义了,你看到的这条要求应该是专指在简并因物的设计中,而在普通引物设计中没有这条规则。
在普通引物设计中显然是多一个碱基会增加它的特异性。而简并引物是不知道dna序列只知道蛋白序列的情况下猜测dna序列,当然是要降低它的简并性。如果最后一个碱基(引物3‘)落在密码子第三位,那还不如去掉它,因为加上它会一下增加简并引物数量,或是降低特定引物的特异性
如果考虑引物tm值等不能简单去掉或再加的,就稍移动一下再修改。

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为什么引物3′端要避开密码子的第3位?不要告诉我说是简并性,百度百科里的我自己也会看.请详细解释.请告诉我假如没有避开,会出现什么情况.谢谢! 基因克隆中有关点突变引物设计问题我需要用引物设计点突变一段基因的3‘端几组氨基酸密码子(每次突变一个氨基酸密码子),突变的密码子已确定,不能用密码子的兼并性,想请问一下各位 如果起始密码子ATG出现在引物的3′端可以吗?根据已知的N端氨基酸序列设计引物其中M只能译为ATG,还在最后 什么是前引物,后引物为什么引物还分前后?是不是双链打开后一个引物在一条链的3'端 另一个在5'端,一前一后? PCR中正向引物和反向引物的概念和具体作用?正向引物指什么?反向引物指什么?一般来说DNA的合成不都是从5'-3’方向合成的吗?这样的话要反向引物做什么? PCR设计和组氨酸密码子要设计一对PCR引物,各含有九个与基因同源的核苷酸(引物一共十八个核苷酸),要求得到的目的基因N端有一个起始密码子,其后是六个组氨酸密码子,另设计一对引物使C PCR技术为什么要用引物没有引物行不行?体内的DNA复制不就没有引物吗?引物在PCR中的作用是什么 引物3 端前几个碱基不配对还能扩出产物吗?我是说在PCR时,引物出现错配到300bp,但它的3端前3个碱基没和300bp处配上.引物也可以在300bp处扩吧?只是扩时是从引物的第4个也就是和模板开始配对的 密码子与反密码子密码子UGC 的反密码子是GCA 为什么不是 CGU呢?是不是反密码子与密码子前后两个字母要换过来? 请问起始密码子和终止密码子的反密码子的tRNA(转运RNA)都会携带氨基酸吗?为什么说有64种密码子,其中有61种氨基酸密码子(包括起始密码子)及3个终止密码子,那意思是说起始密码子对应 基因中编码区转录后形成mRNA上的第一个密码子一定是起始密码子吗 如果不是 起始密码子之前的密码子不翻译吗 基因中编码区转录后形成mRNA上的第一个密码子一定是起始密码子吗 如果不是 起始密码子之前的密码子不翻译吗 RNA的翻译中,mRNA密码子有64种,终极密码子为什么有3种,tRNA的密码子为什么是61种? 为什么密码子的第三位碱基有一定的自由度? 请问PET28b表达载体上有起始密码子和终止密码子吗?我要用该载体表达蛋白,不知道需不需要在引物中加上起始和终止密码子? 有关PCR技术问题引物是可以直接和单链DNA进行配对的吗?如果该单链DNA中(非3’端)可以和引物进行配对,那为什么引物还要从3’端开始?而不直接与中间的进行配对呢?而且为什么每次配对都 引物3'的第一个碱基不配这个引物可以用吗?如果引物其他碱基都能匹配,只3’第一个碱基不配的话,这个引物可以扩增吗?NTP能结合到模板上吗 为什么3个碱基确定一个密码子?