生物信息学软件数据库的运用老师给了下面序列,让用软件分析,但我不知道这是啥的序列,怎样知道呢?是用NCBI查么?怎么查?
来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/12/25 11:22:58
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生物信息学软件数据库的运用
老师给了下面序列,让用软件分析,但我不知道这是啥的序列,怎样知道呢?是用NCBI查么?怎么查?
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首先可以拿这个序列做blastn和blastx,在NCBI网站上:http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi;
根据blastn或者blastx的结果,根据序列比对结果判断这个DNA序列是编码蛋白质的基因还是其他的类型的DNA;
如果是编码蛋白质的基因序列的话,根据blastx结果,可以找到编码区,并获得它编码的氨基酸序列,也可以得到其他一些信息.
如果是非编码区的DNA序列的话,那就根据blastn的比对结果判断这个序列的来源.
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