DNA什么样的峰是杂峰对于两端都是杂峰的序列,我要人工删除后blast比对,从什么地方开始删呢?什么样的峰是杂峰?
来源：学生作业帮助网 编辑：六六作业网 时间：2024/12/18 13:37:49
DNA什么样的峰是杂峰对于两端都是杂峰的序列,我要人工删除后blast比对,从什么地方开始删呢?什么样的峰是杂峰?
DNA什么样的峰是杂峰
对于两端都是杂峰的序列,我要人工删除后blast比对,从什么地方开始删呢?什么样的峰是杂峰?
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测序公司返回给你有两个文件,一个是文本序列,一个是测序的信号文件.
打开信号文件,强信号也就是所谓的峰,一个峰代表一种碱基,如果某一处不止一个强信号,或者说峰之间相互重叠甚至连绵成一片乃至看不出峰,就说明就是杂峰或者信号干扰严重.一般是测序前20bp以及最后几百bp是这样,这和测序公司的技术水平有关.
http://images.google.cn/imglanding?imgurl=http://liucheng.name/wp-content/uploads/2009/08/Seq-100bp.gif&imgrefurl=http://liucheng.name/918/&usg=__QuCBgxAQx2kiW-82cZSf_ZE0z7g%3D&h=240&w=700&sz=15&hl=zh-CN&um=1&tbnid=_1HtCaa_sKAFRM:&tbnh=48&tbnw=140&prev=/images%3Fq%3D%25E6%25B5%258B%25E5%25BA%258F%25E6%2596%2587%25E4%25BB%25B6%26hl%3Dzh-CN%26rlz%3D1C1_____enCN343CN343%26sa%3DN%26um%3D1%26newwindow%3D1&q=%E6%B5%8B%E5%BA%8F%E6%96%87%E4%BB%B6&rlz=1C1_____enCN343CN343&sa=N&um=1&newwindow=1&start=5
看上面的图中这样一个一个峰很明显的才是有效的序列部分,其余的序列都是无效的.要删除.