谢谢您的热心回答!请问用通用引物扩增及通用引物测序,和我按文献所说的引物来扩增测序有什么不同?提取DNA后,用30pmol 引物264 (5' TGC ACA CAG GCC ACAAGG GA3',对应E.coli 16S rRNA 1046 至 1027),10 pmol 引
来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/12/18 18:05:51
谢谢您的热心回答!请问用通用引物扩增及通用引物测序,和我按文献所说的引物来扩增测序有什么不同?提取DNA后,用30pmol 引物264 (5' TGC ACA CAG GCC ACAAGG GA3',对应E.coli 16S rRNA 1046 至 1027),10 pmol 引
谢谢您的热心回答!请问用通用引物扩增及通用引物测序,和我按文献所说的引物来扩增测序有什么不同?
提取DNA后,用30pmol 引物264 (5' TGC ACA CAG GCC ACAAGG GA3',对应E.coli 16S rRNA 1046 至 1027),10 pmol 引物285(5' GAG AGT TTG ATC CTG GCT CAG3‘;对E.coli 16S rRNA 9 至 30)扩增相当于1Kb碱基.测序引物即上面的244,259.请问一:这样的测序设计,测得是单向还是双向?是测得整个扩增的1Kb,还是仅扩增的这两个测序引物之间的序列?请问二:用通用扩增引物及通用测序引物可以吗?有什么不同?
测序引物244:5’CCCACGCTGCCTCCCGTAG3’.
259:5’TTTCAGAACAACGCGACAA3.分别对应E.coli16SrRNA的361~341和609—590位置
谢谢您的热心回答!请问用通用引物扩增及通用引物测序,和我按文献所说的引物来扩增测序有什么不同?提取DNA后,用30pmol 引物264 (5' TGC ACA CAG GCC ACAAGG GA3',对应E.coli 16S rRNA 1046 至 1027),10 pmol 引
一、单向还是双向的话根据你的需求来决定,1K的话一个反应基本也能测出一大半呢(700-800bp左右)如果你想得到全部的序列,那建议你测双向并且用你的那个测序引物(244,259)这样的话测出来的序列是从中间往两边走,两头的序列应该能测全.而如果用你扩增的引物测的话是从两头往中间走,并且你这个有1K,这样测的话可能两头的序列会测不全.
二、引物的话用扩增和测序的都可以,只要你设计的扩增引物没有什么特殊结构、过长或过短一般用来测序都没什么大问题