perl分析基因序列就是给出一个.fa类型的文件,找出其中的N长度,GC长度,GC比例等信息.

来源：学生作业帮助网编辑：六六作业网时间：2024/11/08 08:38:37

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perl分析基因序列
就是给出一个.fa类型的文件,找出其中的N长度,GC长度,GC比例等信息.

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#!/usr/bin/perl -w
use strict;
open my $fhin,$ARGV[0];
my ($seq,$g,$c);
while(my $line = ){
chomp($line);
$seq .= $line;
print $line;
$g += () = $line m/[Gg]/g;
$c += () = $line m/[Cc]/g;
}
my $length = length($seq);
print "Sequence length is:".$length."\nContains ".$g." Gs and ".$c." Cs\nGC percentage is:".(($g+$c)/$length).".\n";

perl分析基因序列就是给出一个.fa类型的文件,找出其中的N长度,GC长度,GC比例等信息. 如何利用生物信息学分析一个基因的DNA序列我想找一个基因序列进行分析,我该去哪找? 基因序列比较怎么分析? 如何查找基因序列分析软件分子生物学中分析基因序列怎么分析根据基因序列,推断出氨基酸序列如题!给出了一下的DNA序列,求出完整的氨基酸序列!CAGGAGACCGACAGCCAGCAGCACACGCAG就是上面这个DNA序列,然后要求写出完整的氨基酸序列,重赏跪谢! 怎么用NCBI查找一个基因的序列,希望能给出我详细的步骤, 生物信息学基因序列分析!明天要交啊!就是开放阅读框,BLAST等等... 什么是16S rDNA基因序列分析怎样分析基因序列比对结果写一个随机DNA序列 100bp用的是PERL 怎么从genbank中找序列我现在在做一个生物的基因序列分析,需要从GENBANK中找一些别的相似基因做对比. 怎么下载AUG上游500bp和下游500bp的基因序列?线虫物种,所有基因.那位大仙帮我指点指点,perl语言实现核苷酸序列转换蛋白质序列已知一个基因的核苷酸序列,如何将它转变成蛋白质序列? 如何查找一个基因的特异性序列和保守型序列? 有两个fastaq格式的DNA序列文件,想写一个perl程序完成!有两个fastaq格式的DNA序列文件,想同时把每个文件中每组断片的两端精度小于10的基因删除,之后再将每组平均精度低于30的断片删除,想写一氨基酸序列分析,ncbi上哪里可以分析一段基因序列哪一段是内含子?