【求助/交流】如何根据相近属种已知基因来设计引物去PCR未知基因

来源：学生作业帮助网编辑：六六作业网时间：2024/11/28 12:25:48

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【求助/交流】如何根据相近属种已知基因来设计引物去PCR未知基因
可以遵循的逻辑是比较已知的不同种属该基因序列,看看有没有很保守区.想要全长就很难了.:tiger05:ben1147(站内联系TA)EST库里blast找同源的,本物种里的est序列,拼接得到尽量长并且准确的序列,设计引物P,得到片段后RACE
要么直接用这个已知序列设计引物,多设计几对,碰巧哪对在保守区能P出来,就OK了.克隆测序,再做RACE.引物里可以加简并碱基,提高成功率,但是以特异性下降为代价,并且增加产物分析难度.
EST库里blast找同源的,本物种里的est序列,拼接得到尽量长并且准确的序列,设计引物P,得到片段后RACE
要么直接用这个已知序列设计引物,多设计几对,碰巧哪对在保守区能P出来,就OK了.克隆测序,再做RACE....我打算从其他几个种属的糖基转移酶氨基酸序列的两个保守区域设计简并引物,通过PCR 方法扩增出相应的DNA 片段.但是这样成功的概率有多大?ben1147(站内联系TA)Originally posted by 小丁山 at 2010-10-12 16:43:34:
简并引物啦,希望是有的我从来没有做过这方面的实验,所以一无所知啊

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