miRNA测序后还需要做哪些分析啊?
来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/12/18 18:55:23
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如果是大规模测序,你可能需要基因组或者转录组,找出能map到基因组或转录组上的miRNA,然后找出其中已经有的已知的该物种miRNA,再分析未知的,即能够与其他物种已知miRNA比对上的保守miRNA和不能比对到其他物种已知miRNA的非保守miRNA,然后对于已知和未知的并且有基因组的可以找出其在基因上的位置,对于未知的需要通过物种cDNA和找到target等.
如果只是少量的小RNA测序,可以直接找出其基因上的位置和target.
你是要做什么?一般就是去targetscan找找可能的target然后做Luciferase验证 然后再做机理的咯
找到它所调控的基因及序列,通常可以通过过表达和基因突变来得知。
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