基因多重序列比对

来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/12/28 18:43:24
基因多重序列比对基因多重序列比对基因多重序列比对多重序列比对(Multiplesequencealignment;MSA)是对三个以上的生物学序列(biologicalsequence),如蛋白质序列

基因多重序列比对
基因多重序列比对

基因多重序列比对
多重序列比对(Multiple sequence alignment;MSA)是对三个以上的生物学序列(biological sequence),如蛋白质序列、DNA序列或RNA序列所作的序列比对.一般来说,是输入一组假定拥有演化关系的序列.从MSA的结果可推导出序列的同源性,而种系发生关系也可引导出这些序列共同的演化始祖.如右图般的视觉化叙述可描绘出各种突变事件,例如点突变的单格变化,或是如删除突变与插入突变,可使各个序列之间产生鸿沟.MSA常用来研究序列的保守(conservation),或是蛋白质结构域的三级结构与二级结构,甚至是个别的氨基酸或核苷酸.

是对三个以上基因序列所进行比对。一般来说,是输入一组假定拥有演化关系的序列。从多序列比对的结果可推导出序列的同源性,而种系发生关系也可引导出这些序列共同的演化始祖。

基因多重序列比对 怎样定义基因序列比对 怎样分析基因序列比对结果 如何使用DNAMAN软件进行多重序列比对 如何在NCBI中进行基因序列比对,比如小鼠p53基因与人类p53基因的比对 怎样进行基因组中基因功能相似的多条基因序列进行多序列比对? 克隆未知基因的序列,测序后BLAST进行了比对,是我们想要的序列,接下来对序列还要进行什么分析? 基因序列BLAST比对时,Max ident 低于90%,可以做进化分析吗? 动物dna序列为什么在ncbi上比对完和植物的该基因相似 经过同源比对得到一个基因的序列,我怎样才能知道该基因的保守区域呢? BLAST 蛋白比对求助请问测序结果和已公开序列的基因蛋白比对为99%,能否确定其为新基因还是未公开序列的基因中的某个?还需要做什么? 论文上说某个基因与某个基因的同源性达到百分之多少?同源性指两个基因的整个序列比对,得出的百分比吗? 如何使用DNAMAN软件将测序的序列翻译成氨基酸序列?怎么和已知的基因进行比对?麻烦具体点,非常感 怎样查找一种病毒蛋白所有不同亚型的基因序列?我想比对一下我这个蛋白的序列保守型, 已经知道基因序列,怎么知道它的Gene ontology?有没有这样的数据库,输入序列,它自己比对然后作GO注释? 有谁知道NCBI blast检测基因序列比对结果怎么看的吗?求懂的大神们指教 我最近在构建RNAi载体.在寻找目的基因cDNA与其他基因的非同源序列时,是与DNA比对,还是与cDNA?谢 断裂基因中的插入序列就是内含子,对不?