细菌16s rdna测序后怎么比对和构建系统发育树,老师不管我们了

来源：学生作业帮助网编辑：六六作业网时间：2024/12/23 00:32:17

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有很多方法,可以下载软件也可以在线构建.
在线构建可将你的序列输入PUBMED的Blastn中进行对比,结果中有一种就是系统发育树,但里面残余对比的序列太多,逆序挑选一下.
软件有很多,比较简单的是DNAstar中的Megalin,但结果比较粗.
推荐用Clustal X软件进行同源性比对后,运用MEGA3.0软件进行系统发育分析并绘制系统发育树,也很简单,看看说明就会.
比较公认的严谨的是philip系列软件,但操作复杂.

细菌16s rdna测序后怎么比对和构建系统发育树,老师不管我们了请问细菌16S rDNA序列分析以后,怎么构建进化树细菌的16S rDNA序列测定能对其种属鉴定到什么程度 or种?生理生化测定是在16S rDNA之前还是之后? 细菌16S rDNA通用引物有哪些? 细菌16 S rDNA基因的V3区引物 16S rDNA测序中cultured和uncultured是什么? 为什么我们进行16S rDNA测序时,要将扩增产物导入的细菌中,而不直接对纯化后的PCR产物直接测序? 标本中存在两种细菌16s rDNA 如何测序? 细菌16S rDNA 序列比对,菌种鉴定中,已测出待定菌种的16SrDNA序列.那么：1、在NCBI上比对时,有三个属的多个已知菌种与新菌匹配率都95%以上,值最高的那个属其实真的在预料之外,而且文献中也没细菌16 S rDNA完整基因的通用引物越多越好,省的自己设计,我没时间急呀~ 什么是16S rDNA基因序列分析求翻译汉译英语句要通顺【结果】分离纯化后得到一株革兰氏阴性,无芽孢的杆状纯种细菌,测序后16S rDNA片段长度为1477bp,菌株与假单胞菌属亲缘关系最为接近,16S rDNA基因相似性达到99%,初步细菌进化树怎么构建怎么在NCBI上检索干酪乳杆菌的16S rDNA序列有原核生物16s rDNA v3或v6区通用引物吗?要能够同时扩增蓝藻和细菌的,最好还有放线菌等其他原核生物.是不是有商业化的这种通用引物的混合物商品? 为何细菌种系发生关系鉴定时采用的是16S rDNA,而不用5或23S的?同题 S rDNA基因的V3区引物与16SrDNA 基因序列的扩增采用细菌通用引物之间有什么区别呢? 沈阳什么地方可以进行16S rDNA扩增、测序?