大肠杆菌密码子偏好性现在我要根据氨基酸序列来推测出mRNA的序列,需要在大肠杆菌中表达,请问如何选择密码子啊?

来源：学生作业帮助网编辑：六六作业网时间：2024/12/22 10:24:05

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大肠杆菌密码子偏好性
现在我要根据氨基酸序列来推测出mRNA的序列,需要在大肠杆菌中表达,请问如何选择密码子啊?

大肠杆菌密码子偏好性现在我要根据氨基酸序列来推测出mRNA的序列,需要在大肠杆菌中表达,请问如何选择密码子啊?
题名[中]: 密码子使用数据库
题名[英]: Codon Usage Database
关键词[中]: 密码子使用表/密码子/物种/使用频率/数据库/基因转录
关键词[英]: Codon Usage Table/Codon/Species/Usage Frequency/Database/Gene Transcription
创建者[英文名]: Ikemura, Toshimichi
创建者地址[英]: Laboratory of Evolutionary Genetics, National Institute of Genetics
出版者[英文名]: Ikemura, Toshimichi
关联.是部分[URI]: http://www.kazusa.or.jp/
资源描述:
密码子使用数据库是CUTG的WWW延伸版本,物种密码子使用频率可以从该网站查询.查询可以通过物种拉丁名或其子字符串搜索.每个物种密码子使用表包括密码子使用的频率（千分比）和每个密码子在物种所有CDS中使用的总数.现在数据库中已包括16591种物种或700501个蛋白编码基因全序列.
我来推荐一个Codon Usage Analyzer（见链接）
其与Codon Usage Database 结合使用,使你的密码优化变得更简单!
http://bioinformatics.org/codon/cgi-bin/codon.cgi

大肠杆菌密码子偏好性现在我要根据氨基酸序列来推测出mRNA的序列,需要在大肠杆菌中表达,请问如何选择密码子啊? 密码子偏好性研究密码子的偏好性怎么理解?rt 如何在NCBI上得到猪的CDS序列我要进行猪密码子的偏好性分析,可还不知道怎么得到猪的CDS序列, 已知氨基酸序列,人工合成基因,在特定受体细胞中表达,如何挑选密码子?（重点：包含偏好性的问题）如何在NCBI中查基因密码子偏好性判断转运RNA上携带的氨基酸种类我有一道题里转运RNA上携带的反密码子和与其对应的密码子都告诉了,还给了一个密码子和氨基酸种类的表格,我应该根据密码子还是反密码子找其对应的氨基 .在氨基酸的遗传密码子中..哪些密码子是要我们记住计算翻译的氨基酸时什么时候要考虑终止密码子? 同义密码子偏好性问题在做论文的,想问下同义密码子偏好性的相关问题.比如植物、动物、细菌、癌变基因等基因的C-G-T-A偏好性情况,是否有个结论的,比如植物基因偏好于以C-G结尾啥的.有相基因克隆中有关点突变引物设计问题我需要用引物设计点突变一段基因的3‘端几组氨基酸密码子（每次突变一个氨基酸密码子）,突变的密码子已确定,不能用密码子的兼并性,想请问一下各位决定氨基酸的密码子指密码子与氨基酸的关系终止密码子能不能编制氨基酸翻译一个蛋白质可以没有终止密码子吗比如说现在题目告诉了氨基酸的数量问基因至少多少碱基要不要氨基酸数加上1再乘以3?不是乘以3是乘以6说错没人能明确告诉我的吗别给我这种复制... 如果起始密码子ATG出现在引物的3′端可以吗?根据已知的N端氨基酸序列设计引物其中M只能译为ATG,还在最后大肠杆菌能表达多大蛋白我想表达一个90kDa的蛋白,用大肠杆菌、pET32a载体,请问可以表达吗?引物设计的时候,我这个片段本来没有起始密码子ATG、有终止密码子TCC,请问需在引物设计时要加上起已知氨基酸序列,合成基因应如何挑选密码子?因为有简并性的问题,所以一种氨基酸对应好几种密码子呢,怎么办?