设计引物的时候,我比对氨基酸序列,由于保守性很高,老师让我用核苷酸序列比对.我比对氨基酸序列,由于保守性及较高,老师让我用核苷酸序列比对.直接用核苷酸序列设计引物,由于核苷酸长

来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/12/04 03:32:36
设计引物的时候,我比对氨基酸序列,由于保守性很高,老师让我用核苷酸序列比对.我比对氨基酸序列,由于保守性及较高,老师让我用核苷酸序列比对.直接用核苷酸序列设计引物,由于核苷酸长设计引物的时候,我比对氨

设计引物的时候,我比对氨基酸序列,由于保守性很高,老师让我用核苷酸序列比对.我比对氨基酸序列,由于保守性及较高,老师让我用核苷酸序列比对.直接用核苷酸序列设计引物,由于核苷酸长
设计引物的时候,我比对氨基酸序列,由于保守性很高,老师让我用核苷酸序列比对.
我比对氨基酸序列,由于保守性及较高,老师让我用核苷酸序列比对.直接用核苷酸序列设计引物,由于核苷酸长度不一,但编码区CDS是差不多.抠出CDS比对,相似性还是比较理想的.CDS是小写的.然后也没对齐.还有数字,跟全长核苷酸序列不一样.我自己整理下格式,前面加个大于号,变成FAST格式.有的软件还不识别.准备手写引物按后用软件打分,哪位朋友有这方面的经验吗?没分了.悲催.求义务帮助.

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要设计简并引物是么?

最好还是使用CDS序列来做比对,然后根据保守区设计简并引物,CDS两端的非翻译区在物种间变化太大,不适合设计引物.

把获得各个物种的CDS做成fasta格式的,序列最好处理成纯序列格式的不含其它任何字符.然后用比对软件比对一下,如mega,DNAman或者是vector NTI里的比对工具都可以做比对.

在比对结果里找到非常保守的区域就可以设计简并引物了.

设计的简并引物可以根据经验公式自个算Tm值.不用计较打分的问题.因为你只能在保守区设计引物.

图是做的DNA序列比对,有保守区和不保守区.我觉得,引物的3'端最好位于最保守的区域.

设计引物的时候,我比对氨基酸序列,由于保守性很高,老师让我用核苷酸序列比对.我比对氨基酸序列,由于保守性及较高,老师让我用核苷酸序列比对.直接用核苷酸序列设计引物,由于核苷酸长 blast检验引物特异性NCBI上没有我所要物种的某基因序列,设计引物时我用人的序列做模版,想问下还有没有blast比对的意义,如果有该怎样去比对呢, GKVVLIVNLAT DIRWNFEKFLI是我经蛋白质比对后选取的两个保守序列 怎么进行简并引物的设计 全序列为malhedkriplseysgkvvlivnlatyglnfqyhelnvlqetfpedfvitgfpcnqfalqepaangtelidglmhvrpgngfepnfrlfgkvevngenetplysylkescpstmdefmrsemlhya 用primer-blast检测引物的时候 为什么比对结果中出现要扩增基因的mRNA序列?用cDNA设计的隐物 求助简并引物的设计克隆一个基因,该物种的序列不知道,根据其他物种该基因的序列进行同源比对后设计,是氨基酸比对好些,还是CDS比对好些啊?另外比对之后具体该怎么操作啊.在下是新手,希 引物设计区域选择问题.我设计兼并引物.多序列比对发现三个保守区.一个在中上游,一个在中游,一个在下游.有经验的朋友能告诉我我该选哪个保守区设计引物吗?设计多少对比较好?用来扩增 运用ClustalX进行多序列比对在导入序列时常出现的问题都有那些呢?现在我正在设计引物运用ClustalX进行多序列比对找保守序列但怎么也导入不了序列老提示说是格式不正确,具体都用什么形式 如何设计已知序列的引物 PCR扩增时RNA引物序列设计时,引物序列是与目标基因前的序列互补呢,还是与目标基因互补?我也遇到了这样的问题,做负链RNA病毒RT-PCR的时候,我不知道以哪个为模板设计引物,是用原始序列设计 引物设计,用PRIMER 5 设计引物时,有的mRNA设计出来的引物序列,即使最高分的那对,也有二聚体或交叉,该怎么调整,或怎么设计这种mRNA的引物序列. 如何将氨基酸序列转化为核苷酸序列我想根据氨基酸测序结果设计引物扩增编码序列 能否通过蛋白质部分氨基酸序列设计DNA/RNA引物如果可以,怎么设计, 我要扩增几个CDS序列,构建载体后用来诱导蛋白表达,但是在设计引物的时候很受限制.我想问一下可否在起始 什么样序列的引物对可以耐高温 我有一个100bp左右的目的序列,怎么设计pcr引物.还有,对于对于一个比较大的基因来说,为什么有人会从这个基因的中间设计引物,这样可以p出这个基因吗? 我现在有了一个基因的cDNA序列,现在想找到这个基因的内含子序列,怎么办?听说有一种方法是找相近物种该基因的全序列,然后做比对然后找到内含子位置,再设计引物将内含子区域测序?有没有 设计引物如何选择序列 序列特异性引物怎么设计就是在ssp-pcr的引物怎么样设计的 原理是什么