DNA双酶切后电泳用多大浓度的胶
来源：学生作业帮助网 编辑：六六作业网 时间：2025/01/22 18:48:02
DNA双酶切后电泳用多大浓度的胶
DNA双酶切后电泳用多大浓度的胶
DNA双酶切后电泳用多大浓度的胶
（拟南芥）基因组 DNA 双酶切不会得到大小一致的片段,而是大小不等片段,HpaII识别4碱基,所以切下来的片段会短些,但是是不会看见条带的,只能看见弥散的拖尾很长的DNA条带.
判定甲基化时用甲基化敏感性限制性内切酶-Southern法,这种方法利用甲基化敏感性限制性内切酶对甲基化区的不切割的特性,将DNA消化为不同大小的片段后再进行分析.HpaⅡ能识别CCGG序列,然而当序列中的胞嘧啶发生甲基化时,HpaⅡ不切割,随后进行Southern杂交明确甲基化状态.根据指定不同片段之间（如500bp和3kb,举例而已,具体最合适的大小请参照文献）的相对比例来判断甲基化的相对变化.
这是一种经典的甲基化研究方法,
优点是：相对简单,成本低廉,甲基化位点明确,实验结果易解释；
缺点是：
1.由于CG不仅仅限于CCGG序列中,因此非该序列中的CG将被忽略；
2.只有检测与转录相关的关键性位点的甲基化状态时,该检测方法的结果才有意义；
3.相对而言,Southern方法较复杂,且需要样本的量大；
4.存在着酶不完全消化引起的假阳性的问题；
5.不适用于混合样本.
一般质粒双酶切的话0.8%-1%的agarose都可以，主要还是看你的酶切条带，如果你酶切后一个片段只有100bp左右，一个要8kb，你要回收小片段肯定要跑个2%的胶我是用拟南芥基因组 DNA 双酶切，EcoRI 和HpaII 这两个酶，就是想看一下酶切的效果，有没有条带，用0.8%的胶可以检测出来么？谢谢了！基因组DNA很大啊，双酶切不一定可以。...
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一般质粒双酶切的话0.8%-1%的agarose都可以，主要还是看你的酶切条带，如果你酶切后一个片段只有100bp左右，一个要8kb，你要回收小片段肯定要跑个2%的胶
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