谁会熟练使用oligo设计引物啊,初学者请教大师

来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/12/25 15:54:16
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第一步:新建序列(或者通过Open直接打开序列)
第二步:确定你要设计引物的起始位点,双击下面的序列可以选中一段(暂时先不要管引物长度)
第三步:选择作为上游引物Select->Forward Primer,然后你会发现下面的序列上有相关引物
第四步:编辑引物,Edit->Forward Primer,可以在文本框中对引物进行添加或删除(在此步骤中加入酶切位点或/和保护碱基),最下面是发夹结构情况,没有发夹结构最好,参与配对形成发夹结构的碱基对越少越好(此窗口还有Tm等信息)
第五步:分析引物Analyze->Duplex Formation->Forward Primer是上游引物形成二聚体情况,不形成最好,参与配对形成二聚体的碱基对越少越好;Analyze->****->Forward Primer(Analyze菜单中有很多可以对引物进行评估的功能,根据菜单名字便可知道)
第六步:设计下游引物(同上游引物设计)
第七步:将设计好的引物进行检查是否移码等等,然后从中Ctrl+C复制出来,然后发给公司合成.
详见《Oligo_7_manual.pdf》(Help->Help Topics或者Ctrl+H)

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