怎样用 NCBI/blast 做蛋白质同源性分析

来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/11/06 04:22:01
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怎样用 NCBI/blast 做蛋白质同源性分析
怎样用 NCBI/blast 做蛋白质同源性分析

怎样用 NCBI/blast 做蛋白质同源性分析
将你需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面Enter Query Sequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的Choose Search Set中选择你需要比对的数据库.Program Selection中的比对可根据个人需要进行选择
如果进行两两比对,或者多个序列的比对,在Enter Query Sequence框中选中Align two or more sequences,在弹出的框中,输入你需要比对的序列
最后点击BLAST即可.
结果得分越高,同源性越高,E值是期望值,得分越低同源性越高

将你要做的蛋白质序列弄上去,再点blast一下,就出来很多同源的了,分数越高的就越。。。

怎样用 NCBI/blast 做蛋白质同源性分析 NCBI Blast 中的Score 知道了一段序列 怎样用ncbi查看蛋白质的三级结构? NCBI上怎么用BLAST对比序列 怎样用primer-blast设计引物 blast ncbi上面由于本人对blast不是很熟悉.5' AACCATTTTGTGGACGAA 3' blast检验引物特异性NCBI上没有我所要物种的某基因序列,设计引物时我用人的序列做模版,想问下还有没有blast比对的意义,如果有该怎样去比对呢, NCBI中蛋白质序列分析 检测到一段N端氨基酸序列DNSCTGEHARYPMVWFIK,现要作PCR扩基因,在NCBI上blast找不同源的,请问怎么设计引根据质谱检测得到一段N端氨基酸序列DNSCTGEHARYPMVWFIK,现在需要作PCR扩基因,在NCBI上blast找不到同 BLAST设计引物的问题?原来用Primer5.0设计引物,但是效果一直都不好,怀疑特异性不强,现在改用BLAST设计引物:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/,但是在这一步,,我不知道如何选择参数,我是做 怎样用NCBI搜索基因组序列啊 ncbi蛋白blast结果ncbi蛋白blast结果中,相同氨基酸残基已经用单字母标出了,不同的残基有的是空白,有的+号, (生物信息学)用NCBI primer-blast设计引物的 时候“misprimed product”是啥意思NCBI primer-blast的数据库构建是什么原理呢? NCBI通过蛋白质序列寻找基因序列 blast 请问在ncbi上blast的时候,需要去除pcr扩增引物序列吗?如题,在blast的时候是否要保留当时做dna扩增时的pcr引物序列.……以前做的一个系列是通过提取重组质粒测序,不去引物的,但是现在做的内 请问NCBI dna BLAST结果中Max score、Total score、E value、Query Coverage、Max Ident 用ncbi中primer-blast设计的引物怎么不告诉我有不有引物二聚体?