将扩增的序列进行blast,相似性偏低,要如何处理?
来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/11/18 00:38:01
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BLAST结果怎么看,怎么看是不是要扩增的目的基因?把两条引物输入,用blastn搜索,输出结果按相似性程度由高到低排列.包括相似序列的名字、位置,如果
1. 你的BLAST的对象是否是同一物种?有没有把人的序列和小鼠的进行比较了?
2. 如果软件操作没有问题,大多数情况是PCR出了问题。建议重新做PCR。做以前先把引物做一次BLAST,有可能是引物的序列设计有问题。
将扩增的序列进行blast,相似性偏低,要如何处理?
用BLAST对比了两个蛋白序列的相似性 这张图的意思是什么.还有这个
如何向往GENEBANK上传序列?往GENEBANK上传序列时,序列是否为测序所得的全部碱基?因为我们测得的序列是将两端少量碱基截取后,才上blast上比对,这样才有较高的相似性.现在上传时是否应上传我
请问生物信息学软件FASTA和BLAST怎么用如果要分析两个序列的相似性,怎么用这两个软件比较?
如何确定这个是否是我要的目的基因序列?本人需要获得一个未知的基因,通过设计引物PCR扩增获得了一个片段,但是在进行Blast比对时,选择Highly similar sequence 的话找不到显著相似的序列,而选择
用primer-blast检测引物的时候 为什么比对结果中出现要扩增基因的mRNA序列?用cDNA设计的隐物
知道引物序列怎么推算扩增片段查到用blast,但是具体提交了自己的上下游引物后怎么让它出结果呢
克隆未知基因的序列,测序后BLAST进行了比对,是我们想要的序列,接下来对序列还要进行什么分析?
如何进行序列同源性分析及BLAST同源性步骤
请问在ncbi上blast的时候,需要去除pcr扩增引物序列吗?如题,在blast的时候是否要保留当时做dna扩增时的pcr引物序列.……以前做的一个系列是通过提取重组质粒测序,不去引物的,但是现在做的内
如何扩增序列未知的基因片段
运用NCBI-BLAST和PDB搜索工具搜P03958序列的相似序列和相似的结构,并对结果进行解?
菜鸟,想进行多序列blast,就5个序列,谁能教教
请教BLAST分析的含义和操作请问BLAST分析的意思,怎么进行BLAST分析,
怎么比较两段DNA序列的相似性
表达序列标签(ESTs)及基因电子克隆请问有没有这方面研究比较透彻的先生老师能指点一下.借助NCBI的BLAST软件可以达到这一目的,将搜索到的高度同源的ESTs进行归类,作为种子库列库,进行序列
AFLP中“通过接头序列和PCR引物3端选择性碱基的识别,对特异性片段进行预扩增和选择性扩增”是啥意思?
如何进行BLAST比对?急救啊,朋友!本人是新手,获得了未知菌的16Srdna序列后,进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/中进行比对,页面中有BLAST Assembled Genomes和Basic BLAST之分,请教我该进入哪里,我不知道该把