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来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/12/18 20:09:09
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如何进行BLAST比对?
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Basic BLAST
根据需要选一个(见下面),点击进入就行了.如果你是要确定是哪种菌,就近第一个Blastn.序列粘贴或者导入,其中Choose Search Set中的Database你要选Others (nr etc.).然后点击Blast就行了.如果同源性有99.99%以上的就说明是那个物种里的.
Blastn 核酸序列搜索逐一核酸数据库中的序列
Blastp 蛋白质序列搜索逐一蛋白质数据库中的序列
Blastx 核酸序列翻译成蛋白质序列后和蛋白质数据库中的序列逐一搜索.
Tblastn 蛋白质序列和核酸数据库中的核酸序列翻译后的蛋白质序列逐一比对
TBlastx 核酸序列翻译成蛋白质序列,再和核酸数据库中的核酸序列6框翻译成的蛋白质序列逐一进行比对

如何进行BLAST比对?急救啊,朋友!本人是新手,获得了未知菌的16Srdna序列后,进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/中进行比对,页面中有BLAST Assembled Genomes和Basic BLAST之分,请教我该进入哪里,我不知道该把 请问如何使用blast进行多序列两两比对 如何进行触电急救 在Blast里面进行序列比对,相似度主要看哪个值 blast是什么意思啊?如何背? 如何正确进行触电急救 如何进行序列同源性分析及BLAST同源性步骤 克隆未知基因的序列,测序后BLAST进行了比对,是我们想要的序列,接下来对序列还要进行什么分析? 地震时如何进行自我急救 blast结果如何分析 请教哪位高人关于水稻某个基因的生物信息学分析该如何做呢?纠结啊,搞了好长时间还是不知从哪下手,急一直徘徊在BLAST序列比对完后, 煤气中毒的急救措施煤气中毒在急救车短时间内不可以到来的情况下,如何利用周围的药店等的药品对中毒者进行急救 使用blast进行蛋白质双序列比对,出现警告.如题,在用本地blast进行蛋白质双序列比对的时候,出现如下的警告Warning: lcl|Query_1 ENSG00000077782: Warning: One or more U or O characters replaced by X for alignment score 对溺水者如何开展岸上急救 实时定量PCR 引物设计的问题,进行Blast后找出一堆序列,请问保守区域是如何找的呢?我以前是先排列,然后在Ugene打开的文件中25个25个的比对,找不匹配小于3个碱基的片段. 如何确定这个是否是我要的目的基因序列?本人需要获得一个未知的基因,通过设计引物PCR扩增获得了一个片段,但是在进行Blast比对时,选择Highly similar sequence 的话找不到显著相似的序列,而选择 如何进行两蛋白质序列比对? 在对溺水者进行急救时,人工呼吸与胸外心脏按压的频率之比为多少