做荧光定量PCR,前期提取RNA的时候一定要加入DNase I和RNase inhibitor吗?我这次提取的RNA,OD260/280是1.88,跑出的条带还行.现在应经反转录为cDNA了,不知道做后期的荧光定量PCR有影响没?
来源:学生作业帮助网 编辑:六六作业网 时间:2024/11/28 12:22:34
做荧光定量PCR,前期提取RNA的时候一定要加入DNase I和RNase inhibitor吗?我这次提取的RNA,OD260/280是1.88,跑出的条带还行.现在应经反转录为cDNA了,不知道做后期的荧光定量PCR有影响没?
做荧光定量PCR,前期提取RNA的时候一定要加入DNase I和RNase inhibitor吗?我这次提取的RNA,OD260/280是1.88,跑出的条带还行.现在应经反转录为cDNA了,不知道做后期的荧光定量PCR有影响没?
做荧光定量PCR,前期提取RNA的时候一定要加入DNase I和RNase inhibitor吗?我这次提取的RNA,OD260/280是1.88,跑出的条带还行.现在应经反转录为cDNA了,不知道做后期的荧光定量PCR有影响没?
1.其实反转录要求不是很高,所有器具消毒操作带手套口罩就行,没必要加RNaseInhibitor
2.OD260/280实际上反应的是蛋白质杂质的比例,可以间接的反应有没有RNA酶污染,所以这个比值低了有可能是RNA酶污染,也可能是提取操作或者试剂问题导致蛋白质残留过多.
做普通跑胶比值要求高一些在1.80-2.20之间;如果做实时定量要求就会低很多,1.5我都做过,影响不是很大,总量少不怕,就怕有差异,关键是点样不容易均一,因为实时定量非常敏感,很小的差异都会放大N倍,一般就靠增大总反应体积来减少误差,30-50微升的时候由操作带来的误差会大大减少,而很多人用的10微升体系做10次能有2次正常结果就不错了.
反转录的DNA是不含内含子的,如果你设计的引物扩增的片段是夸内含子的,就没关系!
1.88,数值偏低了。。cDNA转录前,一定要做DNase处理的。。
你可以检测一下你的样品中有没有DNA污染。。
268/280为1.88,很可能混有DNA。
如果是mRNA的pcr可以通过很多方法降低非特异性,如oligodt作反转录引物、PCR引物用夸内含子的,并通过软件优化等等。但仍有可能有非特异性的产物,你可以先试pcr一次看看。
建议最好还是用DNase I处理,因为即使得到的数据较好,别人质疑你的结果受到DNA非特异的干扰,你是很难证明没有干扰的。
如果你操作熟练、迅速,...
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268/280为1.88,很可能混有DNA。
如果是mRNA的pcr可以通过很多方法降低非特异性,如oligodt作反转录引物、PCR引物用夸内含子的,并通过软件优化等等。但仍有可能有非特异性的产物,你可以先试pcr一次看看。
建议最好还是用DNase I处理,因为即使得到的数据较好,别人质疑你的结果受到DNA非特异的干扰,你是很难证明没有干扰的。
如果你操作熟练、迅速,并不定时检测完整度,inhibitor倒是可以省略
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