做PCR关于引物设计中基因的transcript variant是什么我要用细胞做PCR,看细胞BAX基因的表达.在GENEBANK里面找BAX,却有5个transcript variant!我要设计引物的话用哪个transcript variant啊?求高手指点一二!
来源：学生作业帮助网 编辑：六六作业网 时间：2024/12/21 00:16:15
做PCR关于引物设计中基因的transcript variant是什么我要用细胞做PCR,看细胞BAX基因的表达.在GENEBANK里面找BAX,却有5个transcript variant!我要设计引物的话用哪个transcript variant啊?求高手指点一二!
做PCR关于引物设计中基因的transcript variant是什么
我要用细胞做PCR,看细胞BAX基因的表达.在GENEBANK里面找BAX,却有5个transcript variant!我要设计引物的话用哪个transcript variant啊?
求高手指点一二!
做PCR关于引物设计中基因的transcript variant是什么我要用细胞做PCR,看细胞BAX基因的表达.在GENEBANK里面找BAX,却有5个transcript variant!我要设计引物的话用哪个transcript variant啊?求高手指点一二!
你可以找到BAX的基因序列么?如果可以,那么你可以对比不同的转录本确定外显子和内含子的位置,然后依据你所要研究的对象,在不同的外显子上设计引物.
不过话说回来,你做的是表达分析,你只要针对你感兴趣的转录本设计引物即可,不必要扩增整个转录本的全长.或者,在这5个转录本的共同区域设计一段探针,用核酸杂交来看你的所有转录本的总表达强度.
你所说的情况是由可变剪切造成的。下面是引物设计原则，希望能够对你有所帮助：
Firstly of all, you should know what you want to dectect.
for example, one gene has 2 spliced forms (transcript variants), but contain differenent exons,...
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你所说的情况是由可变剪切造成的。下面是引物设计原则，希望能够对你有所帮助：
Firstly of all, you should know what you want to dectect.
for example, one gene has 2 spliced forms (transcript variants), but contain differenent exons, the first variant contains exon 1, 3, and 4, the second contains exon 1, 2, and 4. so if you want to detect the total level of this gene, you should design the primer to clone the sequence of exon 1 or 4, if you want to dectect just variant 1, you should design the primer based on exon3. others just like this.
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